More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0478 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.91 
 
 
234 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.91 
 
 
234 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.54 
 
 
225 aa  232  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.38 
 
 
230 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.71 
 
 
231 aa  230  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.6 
 
 
239 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
228 aa  224  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
246 aa  224  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  48.17 
 
 
244 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  48.62 
 
 
234 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  48.17 
 
 
234 aa  222  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.62 
 
 
225 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  48.17 
 
 
249 aa  221  7e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  48.2 
 
 
225 aa  221  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.07 
 
 
237 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 
234 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
246 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.22 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.25 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.25 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.71 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  46.79 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.33 
 
 
226 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  46.12 
 
 
230 aa  217  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.36 
 
 
228 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.21 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.79 
 
 
239 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 
228 aa  217  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 
222 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.17 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  47.96 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.71 
 
 
653 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.17 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.79 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  46.12 
 
 
249 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
248 aa  215  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.49 
 
 
244 aa  214  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  45.66 
 
 
388 aa  214  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 
220 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.95 
 
 
252 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  45.87 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4355  AbrB family transcriptional regulator  48.2 
 
 
329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  45.21 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.66 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  45.87 
 
 
241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.41 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 
658 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.41 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.27 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  45.87 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 
231 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  45.41 
 
 
224 aa  211  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.27 
 
 
241 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  44.04 
 
 
253 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  47.51 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
230 aa  211  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.5 
 
 
642 aa  210  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  44.04 
 
 
253 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0179  AbrB family transcriptional regulator  48.2 
 
 
328 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
252 aa  209  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  49.08 
 
 
230 aa  209  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  43.58 
 
 
237 aa  209  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 
240 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  45.95 
 
 
250 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
288 aa  209  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  43.52 
 
 
236 aa  209  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  45.21 
 
 
235 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  47.03 
 
 
242 aa  209  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 
228 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
232 aa  209  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.87 
 
 
252 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  44.8 
 
 
232 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  46.05 
 
 
668 aa  209  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
219 aa  209  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  42.73 
 
 
253 aa  208  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  46.33 
 
 
254 aa  208  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.79 
 
 
242 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
224 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.87 
 
 
228 aa  208  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.49 
 
 
235 aa  207  7e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>