More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1513 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  78.87 
 
 
341 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  77.29 
 
 
344 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  80.2 
 
 
332 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  76.47 
 
 
327 aa  508  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  74.3 
 
 
331 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  76.47 
 
 
334 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  71.17 
 
 
329 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  60.6 
 
 
334 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  58.7 
 
 
343 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  60.31 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  60.18 
 
 
334 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1349  hypothetical protein  51.16 
 
 
324 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  49.35 
 
 
345 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  49.35 
 
 
345 aa  299  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.72 
 
 
336 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0601  hypothetical protein  49.27 
 
 
275 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.19 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.73 
 
 
360 aa  279  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.77 
 
 
339 aa  275  9e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.03 
 
 
333 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.79 
 
 
339 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.67 
 
 
344 aa  271  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 
331 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.09 
 
 
333 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.82 
 
 
328 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.12 
 
 
339 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.7 
 
 
325 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.48 
 
 
355 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  43.5 
 
 
330 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  45.33 
 
 
326 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.76 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.9 
 
 
330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.93 
 
 
335 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.95 
 
 
325 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.95 
 
 
327 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.33 
 
 
321 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.53 
 
 
325 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  44.52 
 
 
331 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  44.33 
 
 
326 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.63 
 
 
327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.38 
 
 
328 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  41.41 
 
 
330 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.95 
 
 
314 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44.97 
 
 
322 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.2 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.33 
 
 
328 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.95 
 
 
304 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.32 
 
 
331 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.32 
 
 
331 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.42 
 
 
330 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  42.91 
 
 
341 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.14 
 
 
353 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  44.92 
 
 
328 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.28 
 
 
339 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.85 
 
 
327 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.76 
 
 
328 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  42.47 
 
 
324 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.53 
 
 
324 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.33 
 
 
335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.97 
 
 
337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.27 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.71 
 
 
325 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.12 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  42.28 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.12 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  42.62 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  41.98 
 
 
329 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.12 
 
 
343 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.49 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.38 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  42.72 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  43.73 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.95 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 
326 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.64 
 
 
335 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.57 
 
 
330 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.57 
 
 
330 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.6 
 
 
330 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.32 
 
 
334 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  40.53 
 
 
332 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.8 
 
 
325 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  41.3 
 
 
334 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  42.23 
 
 
347 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  41.08 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.94 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.37 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.72 
 
 
324 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.28 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.56 
 
 
328 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.81 
 
 
326 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 
330 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.27 
 
 
327 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  41.5 
 
 
333 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.15 
 
 
331 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  37.54 
 
 
327 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.37 
 
 
328 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.02 
 
 
333 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>