More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1717 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1717  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  633  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0485219  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1545  LysR family substrate binding transcriptional regulator  99.68 
 
 		 308 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1654  LysR family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2466  LysR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6924  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671942  normal  0.244663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2833  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2834  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1994  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.576839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4430  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3079  normal  0.432703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.63 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004316  transcriptional regulator LysR family  30.03 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.610995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0418  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00400  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64910  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4419  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1005  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187099  normal  0.59249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2291  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  32.77 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0994  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.35 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4331  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3108  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  0.186906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2203  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.9 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0223993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1393  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2151  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349903  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3604  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0997  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 302 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1282  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.56 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4472  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24960  LysR family transcriptional regulator protein  28.97 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.72 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4008  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0164  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0030  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.58 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.86 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0027  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302128  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.25 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3031  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.25 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.21 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0691  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.27 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3012  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.25 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2761  transcription regulator protein  31.16 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.56038 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.25 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2398  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.25 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2879  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.25 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1533  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.86 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1426  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.508277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0715  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2565  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2531  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3250  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1251  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.17 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2795  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2996  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174451  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  29.55 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1389  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4413  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163519  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0481  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1364  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0933505  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1350  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.960187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0998  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1699  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00239277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2894  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00417784  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2482  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2724  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.51 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000916948  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6790  DNA-binding transcriptional activator GcvA  30.31 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668323  hitchhiker  0.00000431754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.97 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3066  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249094  hitchhiker  0.00377983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3544  DNA-binding transcriptional activator GcvA  28.62 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00470366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.97 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0664  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2271  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2443  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.87 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586469  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0106  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 294 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>