More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2833 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2833  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
291 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6924  transcriptional regulator, LysR family  67.96 
 
 
291 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671942  normal  0.244663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1654  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
308 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1545  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.01 
 
 
308 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1717  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  38.01 
 
 
308 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0485219  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2834  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2466  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1994  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 
311 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.576839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0214  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.79 
 
 
334 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0501  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.81 
 
 
322 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0370633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
317 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4215  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.14 
 
 
322 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1052  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3221  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000086091  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0999  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.35 
 
 
305 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272283  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1948  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 
311 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244059  normal  0.065003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2271  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 
311 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3250  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 
314 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3805  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.33 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000401969  unclonable  0.0000000245083 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4553  hypothetical protein  33.67 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2267  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000460407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2203  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.88 
 
 
303 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0223993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6233  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.79 
 
 
328 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0383  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.03 
 
 
320 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2404  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
305 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0414  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.1 
 
 
348 aa  136  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0376293  normal  0.0295817 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2890  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.79 
 
 
329 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2275  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.79 
 
 
329 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2900  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.79 
 
 
329 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1372  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.35 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0055  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.35 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0221  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.35 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0623  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.35 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3189  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.35 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0461  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.35 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3307  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0441  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.59 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3144  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3192  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00535836  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3207  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00274599  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3127  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.89 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000208594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0691  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.77 
 
 
302 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4049  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769313  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4817  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
299 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92045  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4028  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
290 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.69 
 
 
328 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2385  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
301 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4299  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544326  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3254  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.87 
 
 
304 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655611  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3246  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769279  normal  0.647025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0998  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2802  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.1 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1699  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00239277  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2809  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226254  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1246  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2879  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2940  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.1 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01684  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.56 
 
 
313 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1201  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
313 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4486  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
290 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.978726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3137  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 
287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1783  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2291  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.83222 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6772  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6790  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.12 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668323  hitchhiker  0.00000431754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.99 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3108  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  0.186906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.33 
 
 
303 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
309 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
317 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.21 
 
 
293 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4430  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3079  normal  0.432703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1005  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187099  normal  0.59249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1681  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492921  normal  0.530506 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.53 
 
 
303 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.87 
 
 
303 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02659  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0880  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.630361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4072  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2949  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000549414  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2952  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.32585e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0904  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02620  hypothetical protein  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.31 
 
 
303 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3062  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000830878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3114  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.23 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000698481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2176  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1692  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  31.97 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6490  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5904  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0449  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.109175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0418  DNA-binding transcriptional activator GcvA  29.43 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6398  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>