More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1875 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1875  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398277  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  35.83 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.7 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 335 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.78 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.95 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.83 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  32.62 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  33.92 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 341 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  38.79 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.94 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.13 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.42 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.24 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  37.27 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.87 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.24 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  34.32 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  34.32 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.46 
 
 		 348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  34.32 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  36.95 
 
 		 391 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.99 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  33.73 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  34.32 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  34.59 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.75 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  36.6 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.45 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  34.34 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  36.5 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 346 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.94 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  33.99 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  33.99 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.73 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.13 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  32.21 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.67 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.78 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1259  alanine racemase  30.21 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  31.9 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  36.16 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2498  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  33.43 
 
 		 384 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.02 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4738  alanine racemase  39.7 
 
 		 351 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  29.18 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.53 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.59 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  33.77 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  36.69 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.83 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  36.48 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.33 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  34.87 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.7 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>