More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3664 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3664  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  583  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3248  regulatory protein LysR  52.82 
 
 		 299 aa  282  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1060  regulatory protein LysR  44.44 
 
 		 270 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3569  regulatory protein LysR  38.57 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  30.21 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06880  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 306 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0629  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 314 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  29.54 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4256  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.11 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3524  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76062  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0927  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  35.24 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.23 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  30.14 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  30.57 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  22.71 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  29.68 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  28.8 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  28.8 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2563  DNA-binding transcriptional activator XapR  28.8 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000012261  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  32.11 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1931  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.846594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  28.09 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  28.4 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2558  DNA-binding transcriptional activator XapR  25.94 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000632847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  26.52 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  27.87 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  27.87 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  27.87 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3963  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  33.5 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  28.52 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0691  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.780494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>