More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2652 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2398  ABC transporter, inner membrane subunit  49.05 
 
 
761 aa  703    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.220176  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0537  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.79 
 
 
755 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
765 aa  1522    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.77 
 
 
771 aa  755    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.975413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.85 
 
 
755 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383824  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.76 
 
 
775 aa  784    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.67 
 
 
756 aa  786    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137711  normal  0.159136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6147  membrane protein component of ABC phosphate transporter  47.8 
 
 
761 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.22 
 
 
761 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.04 
 
 
753 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.921779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5614  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.26 
 
 
760 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.536938  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.26 
 
 
762 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.245739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48590  Phosphate ABC-transporter, permease protein PstC  47.91 
 
 
762 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.12 
 
 
762 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.690335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70850  membrane protein component of ABC phosphate transporter  49.78 
 
 
677 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.721295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.86 
 
 
762 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212947  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5486  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  49.48 
 
 
677 aa  582  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.08 
 
 
669 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.662544  hitchhiker  0.00483454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
752 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.719566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
751 aa  559  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
751 aa  557  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
752 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 
751 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
752 aa  538  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1408  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  44.05 
 
 
751 aa  538  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0601702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3642  phosphate ABC transporter, permease protein  40.08 
 
 
778 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1723  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  42.84 
 
 
738 aa  528  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01031  hypothetical protein  42.74 
 
 
734 aa  525  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
752 aa  522  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.618473  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004380  phosphate transport system permease protein PstC  42.69 
 
 
734 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
752 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
752 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
752 aa  515  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000210465  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
752 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0241057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
752 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
752 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
752 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.637323  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2454  phosphate import protein, transmembrane component PstC  39.63 
 
 
735 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
719 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0258  phosphate ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
731 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1228  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.56 
 
 
743 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
742 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
724 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.875094  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
722 aa  432  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0656  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.3 
 
 
742 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.770286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
641 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
722 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
718 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
784 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.462831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
743 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0916528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
706 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03151  putative phosphate ABC transporter, permease protein  45.22 
 
 
727 aa  290  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.91 
 
 
325 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.53 
 
 
336 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.53 
 
 
336 aa  151  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  40.97 
 
 
336 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4079  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.73 
 
 
357 aa  146  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.43 
 
 
387 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.091837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1234  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.81 
 
 
387 aa  135  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1244  phosphate ABC transporter permease  33.13 
 
 
387 aa  134  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.81986  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  36.53 
 
 
318 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  46.31 
 
 
297 aa  132  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1619  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.08 
 
 
388 aa  130  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.97 
 
 
350 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.45 
 
 
535 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.78 
 
 
646 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.62 
 
 
645 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  45.03 
 
 
296 aa  128  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0944  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.87 
 
 
387 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.1 
 
 
291 aa  127  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.34 
 
 
290 aa  127  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1039  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.43 
 
 
387 aa  127  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0327987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  33.78 
 
 
298 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.78 
 
 
297 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.14 
 
 
297 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.42 
 
 
303 aa  124  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.3 
 
 
284 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.15 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.34 
 
 
291 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.34 
 
 
291 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.91 
 
 
291 aa  119  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.91 
 
 
309 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  27.54 
 
 
343 aa  117  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  40.34 
 
 
649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.27 
 
 
283 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  35.09 
 
 
310 aa  114  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.85 
 
 
292 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  31.33 
 
 
295 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.21 
 
 
456 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.57 
 
 
303 aa  112  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.56 
 
 
301 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
325 aa  111  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.33 
 
 
314 aa  111  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.84 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.62 
 
 
311 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.06 
 
 
604 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  34.62 
 
 
310 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2277  phosphate ABC transporter permease  34.91 
 
 
460 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  36.6 
 
 
313 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0500  phosphate ABC transporter permease  34.75 
 
 
414 aa  108  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>