More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0180 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_48590  Phosphate ABC-transporter, permease protein PstC  74.25 
 
 		 762 aa  1088    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.05 
 
 		 755 aa  756    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.7 
 
 		 669 aa  951    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.662544  hitchhiker  0.00483454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.47 
 
 		 762 aa  1077    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1723  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  50.54 
 
 		 738 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 		 752 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0241057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5486  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  70.47 
 
 		 677 aa  951    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49 
 
 		 756 aa  680    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137711  normal  0.159136 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.14 
 
 		 751 aa  674    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 		 775 aa  643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.4 
 
 		 753 aa  1049    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.921779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.13 
 
 		 762 aa  1079    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2398  ABC transporter, inner membrane subunit  52.93 
 
 		 761 aa  757    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.220176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5614  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.64 
 
 		 760 aa  1075    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.536938  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.14 
 
 		 752 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.73 
 
 		 752 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.719566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 761 aa  1538    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0537  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.83 
 
 		 755 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 		 752 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.33 
 
 		 751 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.61 
 
 		 752 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 		 752 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.54 
 
 		 752 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.13 
 
 		 751 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70850  membrane protein component of ABC phosphate transporter  72.3 
 
 		 677 aa  973    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.721295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6147  membrane protein component of ABC phosphate transporter  72.27 
 
 		 761 aa  1101    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 		 752 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.47 
 
 		 762 aa  1082    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.245739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 		 752 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.637323  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1408  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  49.12 
 
 		 751 aa  635  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0601702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.66 
 
 		 752 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.618473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.25 
 
 		 771 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 		 752 aa  627  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000210465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3642  phosphate ABC transporter, permease protein  43.71 
 
 		 778 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.22 
 
 		 765 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2454  phosphate import protein, transmembrane component PstC  43.18 
 
 		 735 aa  572  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01031  hypothetical protein  44.12 
 
 		 734 aa  571  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0258  phosphate ABC transporter, permease protein  46.16 
 
 		 731 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004380  phosphate transport system permease protein PstC  43.36 
 
 		 734 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.14 
 
 		 722 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 		 724 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.875094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 		 722 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1228  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.25 
 
 		 743 aa  475  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 		 719 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0656  ABC-type phosphate transport system, permease component  39.47 
 
 		 742 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.770286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 		 742 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 		 718 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 		 743 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0916528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 		 641 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 		 784 aa  384  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.462831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03151  putative phosphate ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 		 727 aa  274  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.79 
 
 		 336 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  41.23 
 
 		 336 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.79 
 
 		 336 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.36 
 
 		 325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1234  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.38 
 
 		 387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.66 
 
 		 318 aa  138  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4079  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.3 
 
 		 357 aa  137  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1244  phosphate ABC transporter permease  34.29 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.81986  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.32 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.091837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.49 
 
 		 291 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1619  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.55 
 
 		 388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0944  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.7 
 
 		 387 aa  128  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 		 645 aa  127  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  44.3 
 
 		 297 aa  127  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.17 
 
 		 493 aa  127  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.72 
 
 		 350 aa  126  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.61 
 
 		 297 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.96 
 
 		 296 aa  125  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.04 
 
 		 343 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.51 
 
 		 646 aa  124  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1039  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.89 
 
 		 387 aa  124  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0327987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.59 
 
 		 297 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  34.72 
 
 		 298 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 		 296 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.21 
 
 		 535 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.5 
 
 		 309 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.37 
 
 		 358 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.84 
 
 		 303 aa  117  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.55 
 
 		 303 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.48 
 
 		 314 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.29 
 
 		 284 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.73 
 
 		 290 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  36.05 
 
 		 302 aa  112  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.99 
 
 		 291 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.67 
 
 		 283 aa  111  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.99 
 
 		 291 aa  111  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.58 
 
 		 456 aa  111  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.99 
 
 		 291 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.67 
 
 		 292 aa  110  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.88 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  35.81 
 
 		 649 aa  108  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  35.41 
 
 		 627 aa  107  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.77 
 
 		 308 aa  107  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.8 
 
 		 566 aa  107  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0202  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  31.65 
 
 		 302 aa  106  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  31.47 
 
 		 295 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.77 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.78 
 
 		 315 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>