More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1698 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.59 
 
 		 755 aa  691    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.87 
 
 		 752 aa  1096    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0241057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3642  phosphate ABC transporter, permease protein  50.45 
 
 		 778 aa  738    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75 
 
 		 752 aa  1090    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.637323  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1723  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  73.17 
 
 		 738 aa  1082    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 752 aa  1535    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.719566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.25 
 
 		 753 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.921779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.6 
 
 		 752 aa  1115    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.13 
 
 		 752 aa  1108    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000210465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.87 
 
 		 752 aa  1096    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2398  ABC transporter, inner membrane subunit  46.59 
 
 		 761 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.220176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5614  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.8 
 
 		 760 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.536938  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6147  membrane protein component of ABC phosphate transporter  49.66 
 
 		 761 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.73 
 
 		 752 aa  1095    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.73 
 
 		 761 aa  648    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.28 
 
 		 751 aa  1055    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.33 
 
 		 751 aa  1134    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48590  Phosphate ABC-transporter, permease protein PstC  50.07 
 
 		 762 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.27 
 
 		 762 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.245739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.8 
 
 		 752 aa  1080    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.54 
 
 		 752 aa  1079    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.28 
 
 		 751 aa  1078    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.6 
 
 		 752 aa  1112    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.618473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.8 
 
 		 752 aa  1108    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.59 
 
 		 762 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1408  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  73.01 
 
 		 751 aa  1085    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0601702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.14 
 
 		 762 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70850  membrane protein component of ABC phosphate transporter  49.85 
 
 		 677 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.721295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5486  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  50.59 
 
 		 677 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.22 
 
 		 669 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.662544  hitchhiker  0.00483454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0537  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.13 
 
 		 755 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01031  hypothetical protein  46.37 
 
 		 734 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 		 756 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137711  normal  0.159136 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2454  phosphate import protein, transmembrane component PstC  45.31 
 
 		 735 aa  598  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004380  phosphate transport system permease protein PstC  45.58 
 
 		 734 aa  598  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.65 
 
 		 775 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 		 771 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975413 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0258  phosphate ABC transporter, permease protein  45.8 
 
 		 731 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 		 765 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.88 
 
 		 724 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.875094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1228  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.57 
 
 		 743 aa  522  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 		 722 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 		 719 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 722 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 		 718 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 		 743 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0916528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.72 
 
 		 742 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0656  ABC-type phosphate transport system, permease component  38.04 
 
 		 742 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.770286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 		 641 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 		 784 aa  410  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.462831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 		 706 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03151  putative phosphate ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 727 aa  293  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.17 
 
 		 325 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.74 
 
 		 336 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.74 
 
 		 336 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  40.17 
 
 		 336 aa  157  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  49.01 
 
 		 318 aa  154  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  46.29 
 
 		 297 aa  145  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1244  phosphate ABC transporter permease  35.24 
 
 		 387 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.81986  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  43.18 
 
 		 298 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.18 
 
 		 297 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.07 
 
 		 646 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1234  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.44 
 
 		 387 aa  140  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1619  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.85 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.04 
 
 		 387 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.091837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4079  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  28.71 
 
 		 357 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.61 
 
 		 297 aa  138  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0944  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.72 
 
 		 387 aa  137  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  44.63 
 
 		 296 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.68 
 
 		 291 aa  137  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.22 
 
 		 645 aa  134  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.35 
 
 		 296 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1039  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.03 
 
 		 387 aa  131  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0327987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.24 
 
 		 350 aa  130  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  43.18 
 
 		 649 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.66 
 
 		 290 aa  128  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  43.67 
 
 		 604 aa  127  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.32 
 
 		 309 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.68 
 
 		 303 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.86 
 
 		 283 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.2 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.78 
 
 		 292 aa  122  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.86 
 
 		 284 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.57 
 
 		 291 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.57 
 
 		 291 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36 
 
 		 291 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.33 
 
 		 301 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.45 
 
 		 303 aa  115  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.11 
 
 		 281 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  42.38 
 
 		 627 aa  114  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2810  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.77 
 
 		 327 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.107493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.34 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  27.87 
 
 		 358 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  38.55 
 
 		 310 aa  111  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.54 
 
 		 290 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 		 325 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25610  phosphate ABC transporter membrane protein  27.24 
 
 		 320 aa  109  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0166325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  41.28 
 
 		 320 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.86 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 		 315 aa  108  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>