More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_5236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.15 
 
 
762 aa  1010    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.245739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.19 
 
 
669 aa  1003    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.662544  hitchhiker  0.00483454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.59 
 
 
762 aa  1011    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212947  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5486  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  74.45 
 
 
677 aa  1020    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  72.67 
 
 
753 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.921779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.59 
 
 
755 aa  711    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383824  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.15 
 
 
762 aa  1008    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.690335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2398  ABC transporter, inner membrane subunit  52.96 
 
 
761 aa  710    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.220176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5614  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  75.63 
 
 
760 aa  1025    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.536938  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6147  membrane protein component of ABC phosphate transporter  97.78 
 
 
761 aa  1294    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48590  Phosphate ABC-transporter, permease protein PstC  74.81 
 
 
762 aa  987    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.3 
 
 
761 aa  969    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.83 
 
 
756 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137711  normal  0.159136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70850  membrane protein component of ABC phosphate transporter  100 
 
 
677 aa  1365    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.721295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.85 
 
 
752 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.719566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0537  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.94 
 
 
755 aa  634  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.46 
 
 
775 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.96 
 
 
751 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.66 
 
 
771 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.975413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.19 
 
 
751 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.41 
 
 
752 aa  621  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1723  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  48.97 
 
 
738 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.9 
 
 
752 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.78 
 
 
751 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
752 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0241057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
752 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.85 
 
 
752 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.27 
 
 
752 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.12 
 
 
752 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1408  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  48.08 
 
 
751 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0601702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.41 
 
 
752 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.618473  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
752 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.637323  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.78 
 
 
765 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.19 
 
 
752 aa  581  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000210465  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3642  phosphate ABC transporter, permease protein  46.47 
 
 
778 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2454  phosphate import protein, transmembrane component PstC  44.19 
 
 
735 aa  522  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01031  hypothetical protein  43.18 
 
 
734 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004380  phosphate transport system permease protein PstC  54.76 
 
 
734 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0258  phosphate ABC transporter, permease protein  48.86 
 
 
731 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
722 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
742 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
722 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
719 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1228  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.34 
 
 
743 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
718 aa  459  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
724 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.875094  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
641 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0656  ABC-type phosphate transport system, permease component  45.39 
 
 
742 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.770286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
743 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0916528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.02 
 
 
706 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
784 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.462831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03151  putative phosphate ABC transporter, permease protein  42.35 
 
 
727 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.79 
 
 
325 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.27 
 
 
336 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.27 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  40.71 
 
 
336 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1234  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.28 
 
 
387 aa  140  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1619  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.81 
 
 
388 aa  138  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.06 
 
 
387 aa  135  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.091837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1244  phosphate ABC transporter permease  34.6 
 
 
387 aa  134  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.81986  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.9 
 
 
318 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.34 
 
 
350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0944  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.39 
 
 
387 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1039  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.1 
 
 
387 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0327987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.84 
 
 
291 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.05 
 
 
297 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4079  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.17 
 
 
357 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  39 
 
 
297 aa  126  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.97 
 
 
343 aa  123  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.7 
 
 
646 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  36.13 
 
 
298 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.67 
 
 
645 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 
296 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.96 
 
 
297 aa  120  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.15 
 
 
296 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.75 
 
 
309 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.3 
 
 
284 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.97 
 
 
291 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.75 
 
 
303 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.71 
 
 
290 aa  114  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.59 
 
 
535 aa  113  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.97 
 
 
291 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.56 
 
 
291 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.06 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  28.16 
 
 
358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.67 
 
 
283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.73 
 
 
292 aa  112  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  40.68 
 
 
649 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.19 
 
 
480 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.61 
 
 
604 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.1 
 
 
303 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.41 
 
 
301 aa  106  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.28 
 
 
290 aa  106  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  29.76 
 
 
295 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.18 
 
 
302 aa  102  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  34.03 
 
 
310 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.29 
 
 
284 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  41.61 
 
 
320 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.75 
 
 
456 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.65 
 
 
566 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>