More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5614 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.64 
 
 		 761 aa  1076    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.06 
 
 		 669 aa  1091    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.662544  hitchhiker  0.00483454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.37 
 
 		 751 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1723  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  49.86 
 
 		 738 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48590  Phosphate ABC-transporter, permease protein PstC  69.07 
 
 		 762 aa  1036    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5486  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  78.29 
 
 		 677 aa  1078    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  77.44 
 
 		 753 aa  1195    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.921779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.27 
 
 		 752 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0241057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2398  ABC transporter, inner membrane subunit  51.29 
 
 		 761 aa  745    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.220176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5614  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 		 760 aa  1543    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.536938  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0537  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.72 
 
 		 755 aa  656    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.99 
 
 		 751 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.14 
 
 		 752 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.28 
 
 		 762 aa  1243    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 		 752 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.637323  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 752 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 752 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.05 
 
 		 751 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 		 756 aa  653    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137711  normal  0.159136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70850  membrane protein component of ABC phosphate transporter  75.63 
 
 		 677 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.721295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.27 
 
 		 752 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 		 752 aa  676    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.719566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.93 
 
 		 752 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.05 
 
 		 755 aa  756    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1408  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  48.78 
 
 		 751 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0601702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.41 
 
 		 762 aa  1253    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 		 752 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 		 775 aa  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6147  membrane protein component of ABC phosphate transporter  75.69 
 
 		 761 aa  1166    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.76 
 
 		 762 aa  1239    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.245739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.79 
 
 		 771 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.98 
 
 		 752 aa  616  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.618473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 765 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.77 
 
 		 752 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000210465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3642  phosphate ABC transporter, permease protein  42.82 
 
 		 778 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01031  hypothetical protein  42.4 
 
 		 734 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2454  phosphate import protein, transmembrane component PstC  41.41 
 
 		 735 aa  542  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004380  phosphate transport system permease protein PstC  41.47 
 
 		 734 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1228  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  40.52 
 
 		 743 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0258  phosphate ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 		 731 aa  502  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 		 719 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.28 
 
 		 722 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.34 
 
 		 722 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 		 724 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.875094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.85 
 
 		 742 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.95 
 
 		 718 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0656  ABC-type phosphate transport system, permease component  36.71 
 
 		 742 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.770286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 		 641 aa  432  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 		 743 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0916528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 		 706 aa  399  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 		 784 aa  378  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.462831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03151  putative phosphate ABC transporter, permease protein  44.06 
 
 		 727 aa  272  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.74 
 
 		 336 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.74 
 
 		 336 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  40.17 
 
 		 336 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.04 
 
 		 325 aa  148  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1234  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.97 
 
 		 387 aa  140  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  37.85 
 
 		 318 aa  134  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.12 
 
 		 387 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.091837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.43 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1244  phosphate ABC transporter permease  34.27 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.81986  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4079  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.03 
 
 		 357 aa  130  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1619  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.6 
 
 		 388 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.56 
 
 		 350 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  39.25 
 
 		 297 aa  128  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0944  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.85 
 
 		 387 aa  127  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.51 
 
 		 291 aa  127  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.5 
 
 		 296 aa  125  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1039  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.8 
 
 		 387 aa  124  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0327987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.18 
 
 		 645 aa  124  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  42.55 
 
 		 298 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.56 
 
 		 297 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.86 
 
 		 646 aa  122  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.13 
 
 		 358 aa  120  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 		 296 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.26 
 
 		 309 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32 
 
 		 297 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.85 
 
 		 290 aa  114  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.5 
 
 		 303 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.86 
 
 		 284 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.6 
 
 		 314 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.3 
 
 		 291 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.02 
 
 		 456 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.67 
 
 		 283 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.3 
 
 		 291 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.3 
 
 		 291 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  40.94 
 
 		 649 aa  108  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  32.64 
 
 		 302 aa  106  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.19 
 
 		 303 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.24 
 
 		 343 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  28.97 
 
 		 295 aa  105  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  31.28 
 
 		 316 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.69 
 
 		 480 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  39.46 
 
 		 316 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  39.46 
 
 		 316 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2810  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  28.48 
 
 		 327 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.107493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  31.28 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  41.61 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.94 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>