More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0704 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
303 aa  596  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  50.69 
 
 
318 aa  292  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  50.87 
 
 
296 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  51.38 
 
 
297 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.1 
 
 
645 aa  260  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.48 
 
 
296 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.48 
 
 
297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  51.11 
 
 
298 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.92 
 
 
297 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.51 
 
 
292 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.32 
 
 
291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.99 
 
 
309 aa  245  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.29 
 
 
646 aa  240  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  51.23 
 
 
627 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  45.1 
 
 
286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.96 
 
 
290 aa  235  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.91 
 
 
286 aa  235  8e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.83 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.64 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  50.63 
 
 
649 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.86 
 
 
291 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.56 
 
 
281 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.05 
 
 
291 aa  231  9e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.05 
 
 
283 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.57 
 
 
325 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.58 
 
 
604 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  47.33 
 
 
286 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.55 
 
 
296 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.03 
 
 
284 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.3 
 
 
291 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  43.96 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.01 
 
 
336 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.01 
 
 
336 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  42.01 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  44.22 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.81 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  44.57 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0991  phosphate ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  44.32 
 
 
301 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.88 
 
 
286 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 
281 aa  207  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.82 
 
 
315 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  44.69 
 
 
322 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1952  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.94 
 
 
344 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.259103  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.74 
 
 
290 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  44.16 
 
 
295 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.08 
 
 
284 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  43.29 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1007  ABC-type phosphate transport system, permease component  42.49 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.383774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.75 
 
 
535 aa  198  7e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0590  ABC-type phosphate transport system, permease component  40.14 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.755174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.44 
 
 
284 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.86 
 
 
299 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000110804  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1593  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.65 
 
 
372 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.980612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0912  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.28 
 
 
352 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.490293  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28130  phosphate ABC transporter membrane protein  37.68 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.28 
 
 
596 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0557  ABC-type phosphate transport system, permease component  40.51 
 
 
319 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.144785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.81 
 
 
314 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  36.48 
 
 
310 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.31 
 
 
296 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2833  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.93 
 
 
321 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0632  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.64 
 
 
296 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.41 
 
 
302 aa  183  3e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0112  phosphate ABC transporter permease  38.85 
 
 
307 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2519  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  38.66 
 
 
328 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.947329  normal  0.39229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0455  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.41 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0751  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
296 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4586  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
296 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0785  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  35.27 
 
 
296 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.349079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0716  phosphate ABC transporter permease  35.27 
 
 
296 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0771  putative phosphate ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 
296 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000245496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0682  phosphate ABC transporter permease  35.27 
 
 
297 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0626  phosphate ABC transporter, permease  35.27 
 
 
297 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0626  phosphate ABC transporter, permease  34.91 
 
 
297 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3552  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.16 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0845  putative phosphate ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.558062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.84 
 
 
324 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.84 
 
 
324 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0176  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.45 
 
 
298 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.18 
 
 
296 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.13 
 
 
336 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.33 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.46 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.46 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  37.25 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.78 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0311  phosphate ABC transporter permease  36.15 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.884328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09841  putative phosphate ABC transporter  36.15 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.398578  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  37.25 
 
 
316 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  36.86 
 
 
316 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  37.25 
 
 
316 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  35.54 
 
 
320 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.23 
 
 
319 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.63 
 
 
328 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  34.81 
 
 
325 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 
316 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>