More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0139 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  94.06 
 
 
286 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  93.01 
 
 
286 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.48 
 
 
281 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.04 
 
 
284 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.94 
 
 
283 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.67 
 
 
291 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.3 
 
 
291 aa  275  9e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.12 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.44 
 
 
284 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.3 
 
 
291 aa  269  5e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50 
 
 
292 aa  267  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  50.96 
 
 
310 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  48.77 
 
 
295 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  48.42 
 
 
295 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.44 
 
 
290 aa  261  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  50.96 
 
 
308 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.47 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  51.34 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  51.72 
 
 
301 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  45.33 
 
 
318 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  50.37 
 
 
290 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  48.33 
 
 
281 aa  247  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.2 
 
 
286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.1 
 
 
303 aa  244  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.47 
 
 
645 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0991  phosphate ABC transporter, permease protein  44.6 
 
 
305 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 
296 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.3 
 
 
284 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  52.57 
 
 
649 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  44.29 
 
 
298 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.77 
 
 
296 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.04 
 
 
604 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.21 
 
 
297 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.25 
 
 
596 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.25 
 
 
646 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1007  ABC-type phosphate transport system, permease component  47.28 
 
 
304 aa  222  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.383774  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28130  phosphate ABC transporter membrane protein  44.69 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1952  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.83 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.259103  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  48.52 
 
 
627 aa  215  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.36 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  42.41 
 
 
297 aa  211  9e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.11 
 
 
297 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.75 
 
 
301 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0590  ABC-type phosphate transport system, permease component  42.61 
 
 
307 aa  208  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.755174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.83 
 
 
299 aa  205  9e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000110804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2833  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.37 
 
 
321 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.36 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1880  ABC-type phosphate transport system, permease component  46.12 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1994  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.34 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.24 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.8 
 
 
303 aa  195  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0626  phosphate ABC transporter, permease  41.76 
 
 
297 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0112  phosphate ABC transporter permease  42.64 
 
 
307 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.42 
 
 
302 aa  194  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0785  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  41.39 
 
 
296 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.349079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0845  putative phosphate ABC transporter, permease protein  41.39 
 
 
296 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.558062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.78 
 
 
287 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000500776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0557  ABC-type phosphate transport system, permease component  42.97 
 
 
319 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.144785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0682  phosphate ABC transporter permease  41.03 
 
 
297 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0626  phosphate ABC transporter, permease  41.03 
 
 
297 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0632  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.03 
 
 
296 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0716  phosphate ABC transporter permease  41.03 
 
 
296 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0771  putative phosphate ABC transporter, permease protein  41.03 
 
 
296 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000245496 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0548  ABC-type phosphate transport system, permease component  45 
 
 
331 aa  192  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000129095  hitchhiker  1.7592900000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 
325 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 
296 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4586  putative phosphate ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0751  putative phosphate ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0455  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.35 
 
 
301 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.41 
 
 
296 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0176  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.92 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.63 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  34.95 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0827  high-affinity phosphate-specific transport system, cytoplasmic membrane component  38.38 
 
 
286 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000176311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.86 
 
 
336 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.86 
 
 
336 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  39.86 
 
 
336 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  33.91 
 
 
295 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2296  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.93 
 
 
295 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.18 
 
 
464 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.36 
 
 
315 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.45 
 
 
315 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.07 
 
 
322 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0912  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.97 
 
 
352 aa  176  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.490293  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.07 
 
 
322 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3552  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.7 
 
 
374 aa  175  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1593  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.16 
 
 
372 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.980612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0127  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.21 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 
325 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  39.44 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.3 
 
 
497 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09841  putative phosphate ABC transporter  38.8 
 
 
317 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.398578  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.88 
 
 
336 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  32.53 
 
 
320 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0311  phosphate ABC transporter permease  38.8 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.884328  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  39.04 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.55 
 
 
456 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>