More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3552 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3552  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
374 aa  732    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0912  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.97 
 
 
352 aa  354  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.490293  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1593  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.07 
 
 
372 aa  330  3e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.980612  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  39.93 
 
 
296 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40 
 
 
645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  43.92 
 
 
297 aa  196  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.51 
 
 
646 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  42.86 
 
 
649 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.75 
 
 
291 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.42 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.09 
 
 
291 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.07 
 
 
301 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.06 
 
 
283 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 
292 aa  186  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.72 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.93 
 
 
290 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.83 
 
 
291 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  41.04 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.19 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  42.26 
 
 
308 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.16 
 
 
303 aa  180  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.04 
 
 
284 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 
327 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  35.79 
 
 
298 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  34.53 
 
 
318 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  42.19 
 
 
627 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.65 
 
 
281 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  42.11 
 
 
322 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  44.02 
 
 
604 aa  170  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  41.92 
 
 
286 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.96 
 
 
286 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.54 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.71 
 
 
296 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
286 aa  166  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  37.96 
 
 
295 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.63 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.09 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4124  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.15 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  36.58 
 
 
316 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  36.19 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  36.58 
 
 
316 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  36.58 
 
 
316 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
290 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  32.79 
 
 
310 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.37 
 
 
284 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.68 
 
 
297 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  37 
 
 
301 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.19 
 
 
314 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.45 
 
 
306 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 
316 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  33.11 
 
 
310 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.57 
 
 
336 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  36.48 
 
 
316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.57 
 
 
336 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  40.57 
 
 
336 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.01 
 
 
301 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.23 
 
 
307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.53 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.88 
 
 
296 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.78 
 
 
535 aa  153  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.42 
 
 
303 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  33.7 
 
 
316 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  33.44 
 
 
295 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1534  phosphate transport system permease protein  33.63 
 
 
489 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718662  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.72 
 
 
307 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  31.49 
 
 
313 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.47 
 
 
315 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 
308 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 
325 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.96 
 
 
287 aa  149  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000500776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.1 
 
 
311 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0331  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.85 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113685  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.6 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  33.45 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.6 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0944  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.33 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.22 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4581  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.54 
 
 
313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3636  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.96 
 
 
304 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.301349  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.61 
 
 
493 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.59 
 
 
322 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.59 
 
 
322 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.69 
 
 
497 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.61 
 
 
329 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
281 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1792  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.57 
 
 
310 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.47 
 
 
319 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1023  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.6 
 
 
309 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0169  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.61 
 
 
493 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.24 
 
 
456 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1052  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.6 
 
 
309 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.130457  hitchhiker  0.0000180725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0493  phosphate ABC transporter permease protein  36.92 
 
 
495 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.54 
 
 
336 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.03 
 
 
315 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.37 
 
 
316 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1227  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  33.77 
 
 
486 aa  144  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.696312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>