More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0068 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
327 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  89.68 
 
 
310 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  88.75 
 
 
322 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  83.77 
 
 
308 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  68.51 
 
 
301 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  66.78 
 
 
301 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  67.25 
 
 
290 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  55.17 
 
 
295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  54.83 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.36 
 
 
284 aa  275  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.5 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.29 
 
 
281 aa  268  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.17 
 
 
286 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.43 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.77 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 
286 aa  249  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 
286 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.24 
 
 
284 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 
281 aa  245  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  44.57 
 
 
296 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.77 
 
 
290 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.61 
 
 
645 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.37 
 
 
309 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28130  phosphate ABC transporter membrane protein  45.91 
 
 
288 aa  229  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2833  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.8 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  41.58 
 
 
318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.65 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.83 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  45.15 
 
 
627 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.65 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  45.55 
 
 
649 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.09 
 
 
291 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.06 
 
 
287 aa  215  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000500776  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.83 
 
 
292 aa  215  9e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.85 
 
 
290 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.49 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.86 
 
 
596 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.57 
 
 
291 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.31 
 
 
297 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  45.09 
 
 
297 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.96 
 
 
646 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.67 
 
 
604 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.47 
 
 
301 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.16 
 
 
296 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2296  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.89 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0127  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.79 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.9 
 
 
303 aa  195  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  38.03 
 
 
298 aa  195  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1952  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.85 
 
 
344 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.259103  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0991  phosphate ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 
305 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0785  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  41.29 
 
 
296 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.349079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  37.79 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0682  phosphate ABC transporter permease  40.91 
 
 
297 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0626  phosphate ABC transporter, permease  40.91 
 
 
297 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0716  phosphate ABC transporter permease  40.91 
 
 
296 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0771  putative phosphate ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
296 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000245496 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0626  phosphate ABC transporter, permease  40.53 
 
 
297 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0912  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.28 
 
 
352 aa  178  9e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.490293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.38 
 
 
325 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 
296 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.33 
 
 
336 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0751  putative phosphate ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
296 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4586  putative phosphate ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
296 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  37.33 
 
 
336 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0845  putative phosphate ABC transporter, permease protein  40.15 
 
 
296 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.558062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.33 
 
 
336 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3552  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.64 
 
 
374 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.16 
 
 
296 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0632  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.39 
 
 
296 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  37.19 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0590  ABC-type phosphate transport system, permease component  35.83 
 
 
307 aa  172  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.755174  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1593  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.35 
 
 
372 aa  172  9e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.980612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.01 
 
 
296 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.72 
 
 
315 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 
325 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3563  phosphate ABC transporter permease  32.89 
 
 
311 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0176  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.4 
 
 
298 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  32.76 
 
 
295 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0583  phosphate ABC transporter permease  40.82 
 
 
296 aa  165  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  34.19 
 
 
310 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0112  phosphate ABC transporter permease  37.07 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.92 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.27 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.05 
 
 
311 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  32.55 
 
 
316 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  32.55 
 
 
316 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
316 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.31 
 
 
336 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  32.55 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0827  high-affinity phosphate-specific transport system, cytoplasmic membrane component  36.4 
 
 
286 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000176311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.81 
 
 
324 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.81 
 
 
324 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
316 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 
316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  32.21 
 
 
316 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0557  ABC-type phosphate transport system, permease component  41.86 
 
 
319 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.144785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
284 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.43 
 
 
336 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.75 
 
 
334 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>