More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2478 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
316 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2332  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  85.44 
 
 
316 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  70.57 
 
 
315 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  67.52 
 
 
322 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  67.52 
 
 
322 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2805  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  66.35 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  62.38 
 
 
328 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  54.46 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08651  putative phosphate ABC transporter  50.48 
 
 
326 aa  311  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.697879  hitchhiker  0.00114126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  52.15 
 
 
329 aa  308  9e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  54.98 
 
 
342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15191  putative phosphate ABC transporter  51.14 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  50.67 
 
 
315 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  50.67 
 
 
315 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2810  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.05 
 
 
327 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.107493 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07751  putative phosphate ABC transporter  50.33 
 
 
315 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0311  phosphate ABC transporter permease  49.5 
 
 
317 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.884328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09841  putative phosphate ABC transporter  49.5 
 
 
317 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.398578  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08661  putative phosphate ABC transporter  49.67 
 
 
315 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2652  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.67 
 
 
322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.472929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2165  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.39 
 
 
322 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.994929  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2657  phosphate ABC transporter inner membrane protein  48.39 
 
 
322 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807772  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3146  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.39 
 
 
322 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.34 
 
 
324 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.34 
 
 
324 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  44.55 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.68 
 
 
329 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.85 
 
 
336 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.76 
 
 
336 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  42.26 
 
 
316 aa  239  5e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  42.26 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.76 
 
 
334 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1601  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.61 
 
 
328 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.33 
 
 
359 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.58 
 
 
316 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.02 
 
 
328 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  42.5 
 
 
340 aa  235  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.71 
 
 
302 aa  235  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.9 
 
 
341 aa  235  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.9 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.67 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  48.01 
 
 
354 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2371  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.67 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.67 
 
 
337 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.95 
 
 
325 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  42.72 
 
 
324 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2205  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.39 
 
 
321 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650136  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  43.12 
 
 
328 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2343  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.67 
 
 
325 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  0.815793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2253  phosphate ABC transporter permease  47.39 
 
 
343 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279432  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2813  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.52 
 
 
322 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  42.24 
 
 
328 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  42.24 
 
 
328 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  42.24 
 
 
328 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  41.8 
 
 
328 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  43.42 
 
 
328 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  43.42 
 
 
328 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  43.42 
 
 
328 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  43.42 
 
 
328 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  39.14 
 
 
324 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  43.42 
 
 
312 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  43.42 
 
 
312 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  43.42 
 
 
312 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  43.42 
 
 
328 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6689  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.07 
 
 
324 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  42.24 
 
 
321 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  42.9 
 
 
319 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  42.9 
 
 
319 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  42.9 
 
 
319 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  42.9 
 
 
319 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  42.9 
 
 
319 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4917  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.05 
 
 
312 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066084  normal  0.437846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5253  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.74 
 
 
324 aa  221  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7427  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.07 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4714  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.33 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.33 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.886508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0889  phosphate ABC transporter permease  41.99 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  43.97 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  43.97 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  43.97 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  43.04 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  44 
 
 
319 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.3 
 
 
319 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  41.19 
 
 
332 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  41.83 
 
 
319 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.83 
 
 
319 aa  219  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  41.83 
 
 
319 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  41.83 
 
 
319 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  41.83 
 
 
319 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  41.83 
 
 
319 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  41.83 
 
 
319 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  43.61 
 
 
324 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  42.72 
 
 
328 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.61 
 
 
324 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  41.83 
 
 
319 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  41.83 
 
 
319 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  42.11 
 
 
324 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2857  phosphate transporter permease subunit PstC  42.01 
 
 
333 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1717  phosphate transporter permease subunit PstC  42.76 
 
 
312 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1267  phosphate transporter permease subunit PstC  41.69 
 
 
333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27434  normal  0.233798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>