More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4409 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
296 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.52 
 
 
291 aa  322  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  48.62 
 
 
296 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.86 
 
 
303 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  50.81 
 
 
297 aa  256  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  44.1 
 
 
298 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.55 
 
 
645 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.92 
 
 
646 aa  252  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.2 
 
 
297 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  42.31 
 
 
318 aa  242  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.73 
 
 
309 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.11 
 
 
296 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.55 
 
 
303 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.4 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.91 
 
 
290 aa  235  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  49.57 
 
 
649 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.71 
 
 
604 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.4 
 
 
292 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.72 
 
 
291 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  49 
 
 
627 aa  225  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.65 
 
 
291 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.3 
 
 
291 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.5 
 
 
325 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.51 
 
 
307 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.46 
 
 
336 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  47.88 
 
 
336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.46 
 
 
336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4124  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.28 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
316 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
316 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.35 
 
 
283 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.56 
 
 
281 aa  209  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.28 
 
 
286 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  38.36 
 
 
320 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.48 
 
 
301 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.54 
 
 
456 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.39 
 
 
315 aa  205  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  35.89 
 
 
316 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  35.89 
 
 
316 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 
316 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  37.11 
 
 
295 aa  202  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  35.54 
 
 
316 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  35.54 
 
 
316 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 
286 aa  202  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  41.22 
 
 
286 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  35.54 
 
 
316 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3636  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.71 
 
 
304 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.301349  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.55 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.49 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.46 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.49 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  35.71 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.33 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1227  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  35.64 
 
 
486 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.696312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  36.11 
 
 
310 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  43.62 
 
 
295 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.94 
 
 
315 aa  195  7e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3628  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 
462 aa  195  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.59 
 
 
480 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2277  phosphate ABC transporter permease  38.49 
 
 
460 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2290  phosphate ABC transporter permease  35.93 
 
 
483 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0331  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.67 
 
 
315 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113685  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.86 
 
 
316 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  35.93 
 
 
313 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.4 
 
 
315 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.97 
 
 
497 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.55 
 
 
308 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  43.21 
 
 
295 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.55 
 
 
308 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.23 
 
 
319 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.53 
 
 
464 aa  191  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2139  phosphate ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
496 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.38 
 
 
306 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.95 
 
 
566 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414974  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2054  phosphate ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
496 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0599  phosphate ABC transporter permease  33.88 
 
 
465 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.070485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.92 
 
 
481 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.21 
 
 
308 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.7 
 
 
535 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.37 
 
 
319 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.87 
 
 
493 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2603  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  34.58 
 
 
481 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1052  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.11 
 
 
309 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.130457  hitchhiker  0.0000180725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1023  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.11 
 
 
309 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.98 
 
 
290 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0169  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.87 
 
 
493 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.92 
 
 
350 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4329  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.92 
 
 
396 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0107359  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
325 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  38.38 
 
 
308 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  38.87 
 
 
310 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1477  phosphate ABC transporter permease  34.63 
 
 
418 aa  185  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.88 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.19 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.94 
 
 
343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2408  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstC-like protein  35.95 
 
 
468 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.54 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>