More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3317 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
464 aa  924    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3754  phosphate ABC transporter, permease protein  60.47 
 
 
465 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1072  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  59.38 
 
 
459 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.335242  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1232  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.04 
 
 
462 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.68269  normal  0.54486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0599  phosphate ABC transporter permease  61.49 
 
 
465 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.070485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3628  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.64 
 
 
462 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2408  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstC-like protein  58.37 
 
 
468 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.33 
 
 
459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.25 
 
 
460 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0169  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.6 
 
 
493 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  67.94 
 
 
566 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414974  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.89 
 
 
493 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.6 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.32 
 
 
497 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1534  phosphate transport system permease protein  46.03 
 
 
489 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718662  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0493  phosphate ABC transporter permease protein  44.4 
 
 
495 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183402  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2139  phosphate ABC transporter, permease protein  49.14 
 
 
496 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2277  phosphate ABC transporter permease  48.22 
 
 
460 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2054  phosphate ABC transporter, permease protein  49.14 
 
 
496 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0825  phosphate ABC transporter permease  52.11 
 
 
458 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4550  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.21 
 
 
480 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.59 
 
 
494 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0500  phosphate ABC transporter permease  60.06 
 
 
414 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1227  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  45.55 
 
 
486 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.696312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.9 
 
 
480 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.75 
 
 
413 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4329  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.58 
 
 
396 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0107359  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2290  phosphate ABC transporter permease  46.88 
 
 
483 aa  364  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0465  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.24 
 
 
410 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.870192  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1858  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.47 
 
 
418 aa  361  2e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1477  phosphate ABC transporter permease  50.41 
 
 
418 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.93 
 
 
481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2603  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  45.73 
 
 
481 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  59.69 
 
 
414 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1261  phosphate ABC transporter permease  45.11 
 
 
492 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.06 
 
 
409 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.392493  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0202  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  49.16 
 
 
302 aa  286  5e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211138  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0717  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  47.32 
 
 
304 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0643  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  47.32 
 
 
304 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0800  phosphate ABC transporter, permease protein  47.99 
 
 
304 aa  280  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1055  putative phosphate ABC transporter, permease protein PstC  46.98 
 
 
304 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0982  phosphate ABC transporter, permease protein  50 
 
 
374 aa  273  3e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72351  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0145  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.26 
 
 
374 aa  272  9e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00254182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  47.68 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.02 
 
 
319 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.49 
 
 
320 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3636  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.25 
 
 
304 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.301349  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.8 
 
 
310 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  45.69 
 
 
310 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.54 
 
 
314 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.86 
 
 
319 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  45.67 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.41 
 
 
306 aa  246  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  42.77 
 
 
320 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.16 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.56 
 
 
307 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.57 
 
 
308 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.48 
 
 
343 aa  240  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.86 
 
 
315 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1023  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.37 
 
 
309 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.74 
 
 
311 aa  237  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1052  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.37 
 
 
309 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.130457  hitchhiker  0.0000180725 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.04 
 
 
324 aa  236  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.482233  normal  0.348466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4124  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.48 
 
 
316 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3563  phosphate ABC transporter permease  41.5 
 
 
311 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.03 
 
 
307 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.81 
 
 
315 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
316 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  42.05 
 
 
310 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  39.61 
 
 
316 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0331  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.75 
 
 
315 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113685  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  37.72 
 
 
316 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  37.72 
 
 
316 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
316 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 
316 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
316 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  37.43 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4581  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.27 
 
 
313 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  37.13 
 
 
316 aa  226  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0204  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.18 
 
 
324 aa  224  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00435822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.19 
 
 
308 aa  223  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.19 
 
 
308 aa  223  8e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
325 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.71 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
308 aa  216  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.77 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.69 
 
 
316 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1792  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.17 
 
 
310 aa  213  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.34 
 
 
358 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  36.09 
 
 
298 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.62 
 
 
292 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.42 
 
 
297 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.31 
 
 
291 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 
296 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.69 
 
 
290 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.64 
 
 
291 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.84 
 
 
297 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 
296 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  36.67 
 
 
318 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.2 
 
 
284 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>