More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0605 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  100 
 
 
295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  98.31 
 
 
295 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  56.55 
 
 
310 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  55.17 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  55.52 
 
 
308 aa  300  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  54.14 
 
 
301 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  56.49 
 
 
290 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  58.72 
 
 
322 aa  291  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.79 
 
 
301 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.02 
 
 
284 aa  287  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.38 
 
 
283 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  51.8 
 
 
281 aa  269  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.79 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.94 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.04 
 
 
290 aa  252  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.07 
 
 
284 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  48.42 
 
 
286 aa  248  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.62 
 
 
286 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28130  phosphate ABC transporter membrane protein  48.29 
 
 
288 aa  242  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  49.12 
 
 
286 aa  241  9e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.12 
 
 
284 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.29 
 
 
291 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.07 
 
 
291 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  49.64 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.55 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  45.14 
 
 
318 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.7 
 
 
290 aa  228  6e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.36 
 
 
292 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.47 
 
 
297 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2833  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.16 
 
 
321 aa  223  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.58 
 
 
287 aa  221  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000500776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.76 
 
 
309 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.08 
 
 
596 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.49 
 
 
645 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  50.61 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.01 
 
 
646 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  52.91 
 
 
649 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.11 
 
 
297 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  40.77 
 
 
298 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1952  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.81 
 
 
344 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.259103  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.93 
 
 
296 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  46.18 
 
 
627 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.29 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.52 
 
 
604 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0991  phosphate ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 
305 aa  193  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104813  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  40.91 
 
 
302 aa  193  3e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.43 
 
 
301 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.33 
 
 
291 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2296  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.66 
 
 
295 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.79 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.33 
 
 
303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.77 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000110804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1994  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.25 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.62 
 
 
296 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.74 
 
 
336 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.74 
 
 
336 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  42.73 
 
 
336 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1007  ABC-type phosphate transport system, permease component  41.09 
 
 
304 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.383774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4586  putative phosphate ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 
296 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0751  putative phosphate ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 
296 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0785  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  39.27 
 
 
296 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.349079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0112  phosphate ABC transporter permease  35.49 
 
 
307 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0682  phosphate ABC transporter permease  38.94 
 
 
297 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0626  phosphate ABC transporter, permease  38.94 
 
 
297 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0771  putative phosphate ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 
296 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000245496 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0716  phosphate ABC transporter permease  38.94 
 
 
296 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0632  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.27 
 
 
296 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0626  phosphate ABC transporter, permease  38.61 
 
 
297 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0845  putative phosphate ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.558062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0127  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.05 
 
 
299 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0176  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39 
 
 
298 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.54 
 
 
296 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.48 
 
 
296 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0590  ABC-type phosphate transport system, permease component  35.15 
 
 
307 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.755174  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  33.91 
 
 
320 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0583  phosphate ABC transporter permease  42.13 
 
 
296 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0912  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.3 
 
 
352 aa  168  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.490293  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
286 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.84 
 
 
314 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3552  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.96 
 
 
374 aa  165  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  32.59 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0557  ABC-type phosphate transport system, permease component  35.03 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.144785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.21 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  35.69 
 
 
313 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0484  phosphate ABC transporter, permease, putative  35.87 
 
 
696 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0317247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.65 
 
 
328 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1477  phosphate ABC transporter permease  34.45 
 
 
418 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2417  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.01 
 
 
303 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  35.29 
 
 
295 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.08 
 
 
310 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.35 
 
 
464 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.21 
 
 
315 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.11 
 
 
324 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1593  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.93 
 
 
372 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.980612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.11 
 
 
324 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 
316 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl234  phosphate ABC transporter permease component  35.69 
 
 
715 aa  159  5e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2120  phosphate ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 
284 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 
316 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001264  phosphate transport system permease protein PstA  33.22 
 
 
287 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>