More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_28130  phosphate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
288 aa  560  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2833  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.83 
 
 
321 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  48.29 
 
 
295 aa  242  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  47.6 
 
 
295 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.1 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  46.26 
 
 
310 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.95 
 
 
301 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  45.91 
 
 
327 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  47.1 
 
 
301 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 
290 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  44.48 
 
 
308 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.29 
 
 
286 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  45.64 
 
 
281 aa  223  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.3 
 
 
283 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.21 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.34 
 
 
284 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  45.91 
 
 
322 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.07 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.43 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.56 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.73 
 
 
290 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40 
 
 
291 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.01 
 
 
281 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  44.28 
 
 
296 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  44.69 
 
 
286 aa  208  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  41.75 
 
 
318 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.14 
 
 
303 aa  205  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.5 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  40.28 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  42.38 
 
 
649 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.76 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.05 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40 
 
 
596 aa  195  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.64 
 
 
291 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.35 
 
 
296 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.44 
 
 
646 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.68 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.75 
 
 
297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.87 
 
 
645 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.6 
 
 
604 aa  189  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  45.08 
 
 
297 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.57 
 
 
287 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000500776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.74 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.1 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  43.6 
 
 
627 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2296  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.68 
 
 
295 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0127  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.01 
 
 
299 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.1 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0991  phosphate ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
305 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1952  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.39 
 
 
344 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.259103  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  36.36 
 
 
313 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0557  ABC-type phosphate transport system, permease component  38.4 
 
 
319 aa  159  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.144785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.42 
 
 
299 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000110804  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1007  ABC-type phosphate transport system, permease component  36.49 
 
 
304 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.383774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4329  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.42 
 
 
396 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0107359  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.64 
 
 
307 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.48 
 
 
325 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1593  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.1 
 
 
372 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.980612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0912  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.14 
 
 
352 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.490293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.78 
 
 
296 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.22 
 
 
315 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0590  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.14 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.755174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.03 
 
 
311 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4586  putative phosphate ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0751  putative phosphate ABC transporter, permease protein  33.11 
 
 
296 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.8 
 
 
314 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0112  phosphate ABC transporter permease  36.4 
 
 
307 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0771  putative phosphate ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000245496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0785  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  32.42 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.349079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0845  putative phosphate ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.558062  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0682  phosphate ABC transporter permease  32.76 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0626  phosphate ABC transporter, permease  32.76 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0626  phosphate ABC transporter, permease  32.42 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0716  phosphate ABC transporter permease  32.76 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0484  phosphate ABC transporter, permease, putative  36.84 
 
 
696 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0317247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0548  ABC-type phosphate transport system, permease component  38.27 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000129095  hitchhiker  1.7592900000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2408  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstC-like protein  33 
 
 
468 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  34.25 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.14 
 
 
336 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.14 
 
 
336 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0583  phosphate ABC transporter permease  44.49 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.08 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  38.14 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.71 
 
 
307 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0632  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.97 
 
 
296 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1534  phosphate transport system permease protein  29.77 
 
 
489 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718662  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.85 
 
 
308 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.85 
 
 
324 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2277  phosphate ABC transporter permease  33.44 
 
 
460 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  31.49 
 
 
320 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.85 
 
 
324 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  32.75 
 
 
295 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0331  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.57 
 
 
315 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113685  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.11 
 
 
310 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.93 
 
 
320 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1994  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.59 
 
 
299 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  37.6 
 
 
302 aa  142  8e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  31.67 
 
 
310 aa  142  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>