More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0548 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0548  ABC-type phosphate transport system, permease component  100 
 
 
331 aa  664    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000129095  hitchhiker  1.7592900000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0590  ABC-type phosphate transport system, permease component  60.61 
 
 
307 aa  363  2e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.755174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0991  phosphate ABC transporter, permease protein  60.54 
 
 
305 aa  354  1e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.98 
 
 
299 aa  338  8e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000110804  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1007  ABC-type phosphate transport system, permease component  62.03 
 
 
304 aa  332  6e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.383774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0557  ABC-type phosphate transport system, permease component  58.11 
 
 
319 aa  325  8.000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.144785  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1880  ABC-type phosphate transport system, permease component  59.93 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1952  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.7 
 
 
344 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.259103  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.52 
 
 
296 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0785  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  48.43 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.349079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0751  putative phosphate ABC transporter, permease protein  48.43 
 
 
296 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4586  putative phosphate ABC transporter, permease protein  48.43 
 
 
296 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0632  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.08 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0682  phosphate ABC transporter permease  48.08 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0626  phosphate ABC transporter, permease  48.08 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0626  phosphate ABC transporter, permease  48.08 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0716  phosphate ABC transporter permease  48.08 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0771  putative phosphate ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000245496 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0845  putative phosphate ABC transporter, permease protein  47.74 
 
 
296 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.558062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.08 
 
 
296 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0112  phosphate ABC transporter permease  50 
 
 
307 aa  269  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1994  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.64 
 
 
299 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0455  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.52 
 
 
301 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0176  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.08 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.93 
 
 
283 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.8 
 
 
286 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  45.16 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  44.09 
 
 
286 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.72 
 
 
291 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.41 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  38.58 
 
 
318 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.32 
 
 
645 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.39 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.43 
 
 
290 aa  179  9e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.37 
 
 
284 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.97 
 
 
291 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.36 
 
 
292 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.88 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  34.06 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.19 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.62 
 
 
291 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.38 
 
 
646 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.74 
 
 
281 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.94 
 
 
303 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.1 
 
 
290 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.9 
 
 
302 aa  168  1e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  41.48 
 
 
649 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  35.2 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.84 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  34.8 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 
295 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.41 
 
 
297 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  37.42 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  38.87 
 
 
627 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.92 
 
 
604 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 
327 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28130  phosphate ABC transporter membrane protein  35.9 
 
 
288 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
296 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  34.46 
 
 
301 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 
290 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.95 
 
 
309 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.5 
 
 
301 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 
281 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  34.87 
 
 
322 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1378  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.57 
 
 
287 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000500776  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  34.96 
 
 
297 aa  152  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.56 
 
 
286 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.36 
 
 
324 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.36 
 
 
324 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2417  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.17 
 
 
303 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.13 
 
 
596 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2548  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.21 
 
 
325 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0190606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.23 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  28.33 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.78 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0407  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  34.53 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.716513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.2 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08661  putative phosphate ABC transporter  35.74 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  29.45 
 
 
295 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.57 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.71 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2296  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.78 
 
 
295 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.78 
 
 
301 aa  146  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.38 
 
 
302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.6 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.52 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.52 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  35.4 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0127  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.57 
 
 
299 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.14 
 
 
325 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07751  putative phosphate ABC transporter  35.05 
 
 
315 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  35.05 
 
 
315 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.18 
 
 
336 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.69 
 
 
322 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0650  phosphate ABC transporter permease  33.66 
 
 
337 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0147  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.69 
 
 
322 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.62 
 
 
328 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2833  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.23 
 
 
321 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  32.13 
 
 
310 aa  143  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 
308 aa  142  9e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>