More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1720 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  97.02 
 
 
336 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
336 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  92.56 
 
 
334 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  78.55 
 
 
324 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  78.55 
 
 
324 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2702  phosphate ABC transporter permease  79.55 
 
 
319 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  56.8 
 
 
354 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.91 
 
 
319 aa  276  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.62 
 
 
302 aa  268  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2810  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.71 
 
 
327 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.107493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.9 
 
 
329 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  50.17 
 
 
342 aa  258  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  43.49 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0481  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  43.71 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  44.12 
 
 
316 aa  251  9.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3268  phosphate ABC transporter, permease protein  49.44 
 
 
331 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  43.52 
 
 
315 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  44.13 
 
 
324 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3105  phosphate ABC transporter permease  49.44 
 
 
331 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44222  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42 
 
 
325 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.97 
 
 
328 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.14 
 
 
316 aa  247  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.62 
 
 
325 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.77 
 
 
322 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.77 
 
 
322 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.41 
 
 
341 aa  245  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  44.41 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1601  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.11 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.32 
 
 
325 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.14 
 
 
322 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  45.76 
 
 
316 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  42.9 
 
 
328 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  42.41 
 
 
328 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  42.41 
 
 
328 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  42.41 
 
 
328 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  42.41 
 
 
328 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  42.68 
 
 
324 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.68 
 
 
324 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.43 
 
 
315 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  42.59 
 
 
328 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  43.65 
 
 
312 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0650  phosphate ABC transporter permease  42.54 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0147  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  41.67 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  41.67 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  41.67 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  46.99 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  43.65 
 
 
312 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  43.65 
 
 
312 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2857  phosphate transporter permease subunit PstC  43.22 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  43 
 
 
343 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1614  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000235869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  42.72 
 
 
324 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  42.21 
 
 
329 aa  232  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  39.29 
 
 
340 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1267  phosphate transporter permease subunit PstC  43.04 
 
 
333 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27434  normal  0.233798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15191  putative phosphate ABC transporter  43 
 
 
307 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  43.52 
 
 
321 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09841  putative phosphate ABC transporter  41.94 
 
 
317 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.398578  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  42.67 
 
 
318 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0311  phosphate ABC transporter permease  41.94 
 
 
317 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.884328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2166  phosphate transporter permease subunit PstC  42.07 
 
 
321 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  42.67 
 
 
318 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1717  phosphate transporter permease subunit PstC  44.85 
 
 
312 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  42.67 
 
 
318 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  41.8 
 
 
328 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  44.1 
 
 
321 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  42.86 
 
 
328 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  39.82 
 
 
332 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  41.9 
 
 
324 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  42.86 
 
 
328 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  43.14 
 
 
326 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08651  putative phosphate ABC transporter  42.58 
 
 
326 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.697879  hitchhiker  0.00114126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  42.72 
 
 
319 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8332  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.37 
 
 
325 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328047  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  42.17 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0353  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.61 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0198  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.49 
 
 
325 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  42.05 
 
 
319 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  225  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  42.05 
 
 
319 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  225  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  225  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  225  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  42.05 
 
 
319 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2332  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  44.19 
 
 
316 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4151  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.11 
 
 
331 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.164424  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  41.02 
 
 
315 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2805  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.09 
 
 
319 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.49 
 
 
328 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0592  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.86 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  41.72 
 
 
319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  41.06 
 
 
315 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  41.06 
 
 
315 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41 
 
 
359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>