More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1880 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1880  ABC-type phosphate transport system, permease component  100 
 
 
307 aa  600  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0991  phosphate ABC transporter, permease protein  66.23 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0590  ABC-type phosphate transport system, permease component  60.19 
 
 
307 aa  374  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.755174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1007  ABC-type phosphate transport system, permease component  67.51 
 
 
304 aa  363  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.383774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0557  ABC-type phosphate transport system, permease component  59.09 
 
 
319 aa  347  1e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.144785  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0548  ABC-type phosphate transport system, permease component  59.93 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000129095  hitchhiker  1.7592900000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1567  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.79 
 
 
299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000110804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1952  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.44 
 
 
344 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.259103  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.67 
 
 
296 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0112  phosphate ABC transporter permease  46.58 
 
 
307 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1994  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.25 
 
 
299 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0632  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.34 
 
 
296 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0785  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  47.04 
 
 
296 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.349079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0682  phosphate ABC transporter permease  46.69 
 
 
297 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0626  phosphate ABC transporter, permease  46.69 
 
 
297 aa  258  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0626  phosphate ABC transporter, permease  46.69 
 
 
297 aa  258  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0771  putative phosphate ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 
296 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000245496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4586  putative phosphate ABC transporter, permease protein  46.34 
 
 
296 aa  258  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0716  phosphate ABC transporter permease  46.69 
 
 
296 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0751  putative phosphate ABC transporter, permease protein  46.34 
 
 
296 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0845  putative phosphate ABC transporter, permease protein  46.34 
 
 
296 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.558062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.34 
 
 
296 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0455  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.11 
 
 
301 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0176  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.65 
 
 
298 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0139  phosphate ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 
286 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0231  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.61 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_147  phosphate ABC transporter, permease protein  44.36 
 
 
286 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.15 
 
 
283 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.42 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.48 
 
 
291 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.86 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.12 
 
 
303 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.46 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.1 
 
 
290 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.79 
 
 
645 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  40.07 
 
 
298 aa  186  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4229  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.32 
 
 
301 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2589  ABC phosphate transporter inner membrane protein PstC  40.21 
 
 
301 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0122175  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  40.41 
 
 
290 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1668  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.6 
 
 
281 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000035104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.09 
 
 
284 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3504  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.26 
 
 
310 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.93 
 
 
646 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.77 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.69 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2839  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.32 
 
 
596 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.86 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2119  phosphate ABC transporter, inner membrane component  40.58 
 
 
308 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.32 
 
 
297 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001263  phosphate transport system permease protein PstC  40 
 
 
310 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1959  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.23 
 
 
290 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.29 
 
 
296 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0068  phosphate ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.532516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0619  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  36.24 
 
 
295 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.637823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0605  phosphate ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
295 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.77912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0094  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.76 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05138  ABC-type phosphate transport system permease component  41.64 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.26 
 
 
284 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000397487  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  42.53 
 
 
604 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.41 
 
 
309 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  38.58 
 
 
649 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  38.28 
 
 
302 aa  158  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1965  phosphate ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
281 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2833  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.22 
 
 
321 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
296 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1117  hypothetical protein  39.32 
 
 
627 aa  155  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.43 
 
 
324 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.43 
 
 
324 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36 
 
 
336 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.05 
 
 
322 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.05 
 
 
322 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.29 
 
 
336 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08661  putative phosphate ABC transporter  33.54 
 
 
315 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  37.85 
 
 
297 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.19 
 
 
464 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.29 
 
 
334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28130  phosphate ABC transporter membrane protein  35.17 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09841  putative phosphate ABC transporter  33.11 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.398578  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0311  phosphate ABC transporter permease  33.11 
 
 
317 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.884328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.8 
 
 
301 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.11 
 
 
319 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.05 
 
 
296 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.04 
 
 
319 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.08 
 
 
319 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.09 
 
 
291 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.97 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  31.92 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07751  putative phosphate ABC transporter  33.23 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.52 
 
 
316 aa  146  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000564451  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0727  phosphate ABC transporter permease  33.23 
 
 
315 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.127565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.13 
 
 
328 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4581  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.33 
 
 
313 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  33.23 
 
 
315 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.88 
 
 
303 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  33.02 
 
 
329 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1885  phosphate ABC transporter permease  36.22 
 
 
285 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.29 
 
 
302 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.07 
 
 
328 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.39 
 
 
336 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.29 
 
 
308 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>