More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0650 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0650  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
337 aa  665    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0147  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0651  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.08 
 
 
329 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2519  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  48.2 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.947329  normal  0.39229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  42.68 
 
 
343 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.54 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  41.69 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.25 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.76 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.76 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  44.97 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2371  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.25 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.54 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1601  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.53 
 
 
328 aa  233  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.4 
 
 
337 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.45 
 
 
322 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.9 
 
 
336 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.81 
 
 
359 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.53 
 
 
329 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.3 
 
 
325 aa  229  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  40.3 
 
 
318 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  40.3 
 
 
318 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  40.3 
 
 
318 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2205  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.89 
 
 
321 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650136  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  39.17 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.17 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.56 
 
 
324 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4917  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.51 
 
 
312 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066084  normal  0.437846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.62 
 
 
317 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  40.06 
 
 
325 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  38.41 
 
 
319 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2253  phosphate ABC transporter permease  45.26 
 
 
343 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279432  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  38.41 
 
 
319 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  38.41 
 
 
319 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.07 
 
 
316 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  38.41 
 
 
319 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  38.41 
 
 
319 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.07 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.04 
 
 
325 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  37.95 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  38.11 
 
 
319 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  37.8 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.8 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  37.8 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  37.8 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  37.8 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  37.8 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  37.8 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  37.8 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  37.8 
 
 
319 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  40.34 
 
 
316 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  40.48 
 
 
316 aa  219  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1091  phosphate ABC transporter permease  39.29 
 
 
329 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2702  phosphate ABC transporter permease  42.01 
 
 
319 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.74 
 
 
319 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1292  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.7 
 
 
338 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3268  phosphate ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2813  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.46 
 
 
322 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2166  phosphate transporter permease subunit PstC  40.97 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450116  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  39.88 
 
 
321 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3105  phosphate ABC transporter permease  41.9 
 
 
331 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44222  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2829  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.37 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594709  normal  0.637207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3294  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.37 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  40.74 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  40.74 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  40.74 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  41.25 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  40.91 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  40.37 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.91 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  39.39 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4151  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.75 
 
 
331 aa  212  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.164424  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  40 
 
 
321 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1717  phosphate transporter permease subunit PstC  39.45 
 
 
312 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  39.02 
 
 
312 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  40 
 
 
328 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7427  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.25 
 
 
324 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  39.02 
 
 
312 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1397  phosphate ABC transporter permease  39.43 
 
 
315 aa  209  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  0.553355 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  39.02 
 
 
312 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  39.02 
 
 
328 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  39.02 
 
 
328 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  39.02 
 
 
328 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  39.02 
 
 
328 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6689  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.18 
 
 
324 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  38.72 
 
 
328 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  40.38 
 
 
328 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09841  putative phosphate ABC transporter  36.5 
 
 
317 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.398578  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  36.96 
 
 
332 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 
302 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  39.47 
 
 
315 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15191  putative phosphate ABC transporter  37.95 
 
 
307 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3538  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.5 
 
 
328 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590785  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  40.67 
 
 
326 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0311  phosphate ABC transporter permease  36.5 
 
 
317 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.884328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  39.69 
 
 
328 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08661  putative phosphate ABC transporter  37.85 
 
 
315 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2810  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.82 
 
 
327 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.107493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1267  phosphate transporter permease subunit PstC  40 
 
 
333 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27434  normal  0.233798 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07751  putative phosphate ABC transporter  37.23 
 
 
315 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07751  putative phosphate ABC transporter  37.23 
 
 
315 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.588684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>