More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0819 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0819  phosphate ABC transporter permease  100 
 
 
315 aa  605  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.83 
 
 
324 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.83 
 
 
324 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.35 
 
 
319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  49.33 
 
 
354 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.79 
 
 
336 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1851  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.37 
 
 
334 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.52 
 
 
336 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.65 
 
 
329 aa  248  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.92 
 
 
302 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  46.93 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  46.51 
 
 
318 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  46.51 
 
 
318 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0198  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.54 
 
 
325 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  46.51 
 
 
318 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  45.87 
 
 
319 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  45.87 
 
 
319 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  45.87 
 
 
319 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  45.87 
 
 
319 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  45.87 
 
 
319 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  45.87 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  45.02 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4151  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.36 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.164424  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  46.38 
 
 
328 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  46.38 
 
 
328 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  46.38 
 
 
328 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  45.72 
 
 
328 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.62 
 
 
316 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  45.33 
 
 
328 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1601  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.97 
 
 
328 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  43.67 
 
 
324 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2702  phosphate ABC transporter permease  44.41 
 
 
319 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.9 
 
 
328 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  44.63 
 
 
328 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  45 
 
 
321 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  44 
 
 
312 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  44 
 
 
328 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  44 
 
 
312 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  44 
 
 
328 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  44 
 
 
328 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.84 
 
 
317 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  44 
 
 
312 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.05 
 
 
325 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  44 
 
 
328 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0481  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  42.86 
 
 
325 aa  226  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  45.98 
 
 
319 aa  225  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2810  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.82 
 
 
327 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.107493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  46.74 
 
 
328 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.38 
 
 
325 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  44.81 
 
 
316 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  44.19 
 
 
332 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  48.65 
 
 
316 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  45.72 
 
 
343 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  46.39 
 
 
328 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  48.12 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.66 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5253  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.9 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2343  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.72 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  0.815793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2166  phosphate transporter permease subunit PstC  45.49 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  46.82 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1292  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.48 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1717  phosphate transporter permease subunit PstC  46.82 
 
 
312 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  44.66 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4264  phosphate transporter permease subunit PstC  45.87 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4585  phosphate transporter permease subunit PstC  45.54 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3105  phosphate ABC transporter permease  45.28 
 
 
331 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44222  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2813  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.08 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  44.79 
 
 
321 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2684  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.96 
 
 
305 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.070579  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3270  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.82 
 
 
331 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7427  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.04 
 
 
324 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3268  phosphate ABC transporter, permease protein  44.95 
 
 
331 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  44.52 
 
 
324 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6689  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.32 
 
 
324 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.52 
 
 
324 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.85 
 
 
359 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0889  phosphate ABC transporter permease  46.64 
 
 
333 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.76 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2371  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.76 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4714  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.01 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2857  phosphate transporter permease subunit PstC  42.72 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.01 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.886508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1267  phosphate transporter permease subunit PstC  42.86 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27434  normal  0.233798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1987  high-affinity phosphate ABC transporter membrane protein  46.33 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.65 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4515  phosphate ABC transporter permease  42.61 
 
 
342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0777  phosphate ABC transporter permease  45.96 
 
 
332 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4000  phosphate transporter permease subunit PstC  44.69 
 
 
319 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  46.42 
 
 
325 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2934  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  44.85 
 
 
326 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.42 
 
 
341 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2205  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.97 
 
 
321 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>