More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1137 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  100 
 
 
325 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1601  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  65.11 
 
 
328 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1292  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  63.24 
 
 
338 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  62.27 
 
 
328 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  63.19 
 
 
328 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  63.19 
 
 
328 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  63.19 
 
 
328 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  63.25 
 
 
319 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  63.93 
 
 
321 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
318 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  61.96 
 
 
328 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  64.57 
 
 
332 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  61.96 
 
 
328 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  61.96 
 
 
328 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  62.58 
 
 
328 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
318 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  64.57 
 
 
312 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
319 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  63.25 
 
 
318 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  61.96 
 
 
328 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  63.25 
 
 
319 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  64.57 
 
 
312 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  64.57 
 
 
312 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2857  phosphate transporter permease subunit PstC  61.73 
 
 
333 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  60.62 
 
 
324 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  64.36 
 
 
319 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.95 
 
 
329 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2166  phosphate transporter permease subunit PstC  66.43 
 
 
321 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1717  phosphate transporter permease subunit PstC  63.28 
 
 
312 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  62.95 
 
 
328 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  66.09 
 
 
321 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  58.15 
 
 
343 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1267  phosphate transporter permease subunit PstC  60.8 
 
 
333 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27434  normal  0.233798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  64.87 
 
 
318 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  62.58 
 
 
337 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.06 
 
 
359 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  61.36 
 
 
316 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  59.38 
 
 
324 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  62.91 
 
 
340 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  61.31 
 
 
316 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  61.31 
 
 
316 aa  363  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  63.11 
 
 
328 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  62.78 
 
 
328 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4264  phosphate transporter permease subunit PstC  62.95 
 
 
319 aa  360  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2813  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.93 
 
 
322 aa  358  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4585  phosphate transporter permease subunit PstC  61.97 
 
 
319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4000  phosphate transporter permease subunit PstC  65.6 
 
 
319 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.8 
 
 
325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  61.18 
 
 
337 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2371  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  61.18 
 
 
337 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4209  phosphate transporter permease subunit PstC  65.12 
 
 
326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2253  phosphate ABC transporter permease  60.84 
 
 
343 aa  345  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279432  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4917  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  62.55 
 
 
312 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066084  normal  0.437846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2205  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  61.69 
 
 
321 aa  341  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650136  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.75 
 
 
328 aa  339  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0636  phosphate ABC transporter permease  56.11 
 
 
332 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5253  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.71 
 
 
324 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1987  high-affinity phosphate ABC transporter membrane protein  57.29 
 
 
332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0889  phosphate ABC transporter permease  56.76 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6689  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.03 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  53.96 
 
 
325 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3268  phosphate ABC transporter, permease protein  61.11 
 
 
331 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.15 
 
 
341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7427  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.35 
 
 
324 aa  325  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3105  phosphate ABC transporter permease  61.11 
 
 
331 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44222  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0777  phosphate ABC transporter permease  57.5 
 
 
332 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2343  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.87 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  0.815793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4714  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.49 
 
 
324 aa  319  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.49 
 
 
324 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.886508 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.09 
 
 
322 aa  318  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0507  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  55.48 
 
 
341 aa  316  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.54837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5265  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.14 
 
 
333 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  54.78 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4922  phosphate ABC transporter permease  57.86 
 
 
333 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.619069  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  53.4 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.4 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.2 
 
 
325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0198  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.69 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.1 
 
 
317 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2684  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.84 
 
 
305 aa  277  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.070579  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3270  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.51 
 
 
331 aa  275  8e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263457  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.01 
 
 
316 aa  264  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000564451  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.46 
 
 
302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1614  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.12 
 
 
331 aa  250  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000235869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.26 
 
 
336 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2974  phosphate ABC transporter inner membrane protein  46.28 
 
 
354 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1720  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.32 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000175747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1517  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.85 
 
 
324 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2559  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.85 
 
 
324 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00389867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>