More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2371 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1487  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
337 aa  656    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2371  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
337 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2627  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  86.94 
 
 
337 aa  551  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.107614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2312  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  87.1 
 
 
359 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0582  phosphate ABC transporter permease  80.76 
 
 
343 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0697516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4917  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  88.14 
 
 
312 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.066084  normal  0.437846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1273  phosphate transport system permease protein  83.99 
 
 
340 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2253  phosphate ABC transporter permease  82.73 
 
 
343 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279432  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2205  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  84.01 
 
 
321 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650136  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2813  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  81.19 
 
 
322 aa  478  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1530  phosphate transporter permease subunit PstC  70.26 
 
 
321 aa  424  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2019  phosphate transporter permease subunit PstC  70.45 
 
 
328 aa  424  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4444  phosphate transporter permease subunit PstC  70.92 
 
 
328 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0883  phosphate transporter permease subunit PstC  67.18 
 
 
332 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0781  phosphate transporter permease subunit PstC  69.41 
 
 
328 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1619  phosphate transporter permease subunit PstC  69.41 
 
 
328 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644753  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2772  phosphate transporter permease subunit PstC  67.29 
 
 
328 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0575  phosphate transporter permease subunit PstC  69.41 
 
 
328 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1292  phosphate transporter permease subunit PstC  69.41 
 
 
328 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2857  phosphate transporter permease subunit PstC  67.58 
 
 
333 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1267  phosphate transporter permease subunit PstC  66.37 
 
 
333 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27434  normal  0.233798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1516  phosphate transporter permease subunit PstC  69.41 
 
 
312 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.847458  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0820  phosphate transporter permease subunit PstC  67.28 
 
 
328 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1486  phosphate transporter permease subunit PstC  69.41 
 
 
312 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1301  phosphate transporter permease subunit PstC  67.28 
 
 
328 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1272  phosphate transporter permease subunit PstC  67.28 
 
 
328 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0576  phosphate transporter permease subunit PstC  69.41 
 
 
312 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4232  phosphate transporter permease subunit PstC  67.55 
 
 
318 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.691548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2166  phosphate transporter permease subunit PstC  71.61 
 
 
321 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4170  phosphate transporter permease subunit PstC  67.55 
 
 
318 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2025  phosphate transporter permease subunit PstC  67.07 
 
 
324 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619161  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4196  phosphate transporter permease subunit PstC  67.55 
 
 
318 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  normal  0.0245807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4244  phosphate transporter permease subunit PstC  66.23 
 
 
319 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4065  phosphate transporter permease subunit PstC  66.23 
 
 
319 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.132116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4187  phosphate transporter permease subunit PstC  66.23 
 
 
319 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1717  phosphate transporter permease subunit PstC  69.93 
 
 
312 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2184  phosphate transporter permease subunit PstC  70.35 
 
 
321 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.184456  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4137  phosphate transporter permease subunit PstC  66.23 
 
 
319 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4081  phosphate transporter permease subunit PstC  66.23 
 
 
319 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03611  phosphate transporter subunit  66.78 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4240  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  66.78 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5156  phosphate transporter permease subunit PstC  66.78 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.558018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4201  phosphate transporter permease subunit PstC  66.78 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03555  hypothetical protein  66.78 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4267  phosphate transporter permease subunit PstC  66.78 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4238  phosphate transporter permease subunit PstC  66.78 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4091  phosphate transporter permease subunit PstC  66.78 
 
 
319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.541621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3942  phosphate transporter permease subunit PstC  66.78 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1190  phosphate transporter permease subunit PstC  67.91 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227903  normal  0.373364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4138  phosphate transporter permease subunit PstC  66.45 
 
 
319 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1178  phosphate transporter permease subunit PstC  67.6 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0013  phosphate transporter permease subunit PstC  65.56 
 
 
318 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468415  normal  0.0760881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4264  phosphate transporter permease subunit PstC  65.58 
 
 
319 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4585  phosphate transporter permease subunit PstC  65.15 
 
 
319 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4000  phosphate transporter permease subunit PstC  66.9 
 
 
319 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4209  phosphate transporter permease subunit PstC  64.47 
 
 
326 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1137  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  61.18 
 
 
325 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2269  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  64.47 
 
 
316 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1601  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  59.28 
 
 
328 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1796  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.86 
 
 
325 aa  345  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00856556  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1927  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  59.27 
 
 
316 aa  342  8e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0123296  normal  0.0315714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2220  phosphate ABC transporter permease  58.01 
 
 
316 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.253336  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1437  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  58.94 
 
 
325 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177965  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1154  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  58.94 
 
 
341 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1292  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  57.89 
 
 
338 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0838  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.31 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1333  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.42 
 
 
325 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3105  phosphate ABC transporter permease  58.89 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44222  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3268  phosphate ABC transporter, permease protein  58.89 
 
 
331 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6689  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.01 
 
 
324 aa  318  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2832  phosphate ABC transporter permease protein  54.67 
 
 
324 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1310  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.97 
 
 
322 aa  316  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.648336  normal  0.22532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00542  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  53.18 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5253  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50.15 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2343  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.85 
 
 
325 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  0.815793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0636  phosphate ABC transporter permease  55.08 
 
 
332 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7427  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.1 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4714  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5181  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.886508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1283  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.82 
 
 
324 aa  305  6e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1347  ABC transporter phosphate permease  51.82 
 
 
324 aa  305  6e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.225213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  52.96 
 
 
328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.222291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0198  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  51.23 
 
 
325 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0507  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  54.9 
 
 
341 aa  299  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.54837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0777  phosphate ABC transporter permease  52.63 
 
 
332 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0889  phosphate ABC transporter permease  53.85 
 
 
333 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1987  high-affinity phosphate ABC transporter membrane protein  53.27 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5265  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.65 
 
 
333 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4922  phosphate ABC transporter permease  52.61 
 
 
333 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.619069  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  49.2 
 
 
317 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0869195  normal  0.668391 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0742  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.93 
 
 
316 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000564451  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3270  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  48.01 
 
 
331 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263457  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2684  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  47.67 
 
 
305 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.070579  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1614  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.29 
 
 
331 aa  252  7e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000235869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0475  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.85 
 
 
302 aa  246  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0407  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  43.28 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.716513  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0650  phosphate ABC transporter permease  43.17 
 
 
337 aa  238  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0147  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2478  phosphate ABC transporter permease  45.67 
 
 
316 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0181  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.04 
 
 
291 aa  233  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2216  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstC  42.04 
 
 
324 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  0.140551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>