More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5040 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.07 
 
 		 669 aa  1061    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.662544  hitchhiker  0.00483454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 752 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0241057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1723  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  49.39 
 
 		 738 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.2 
 
 		 755 aa  760    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5486  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  92.17 
 
 		 677 aa  1243    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 		 753 aa  1523    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.921779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.44 
 
 		 762 aa  1197    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.14 
 
 		 752 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.637323  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 752 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2398  ABC transporter, inner membrane subunit  50.72 
 
 		 761 aa  748    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.220176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5614  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  77.44 
 
 		 760 aa  1192    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.536938  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0537  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.67 
 
 		 755 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.78 
 
 		 762 aa  1186    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48590  Phosphate ABC-transporter, permease protein PstC  69.12 
 
 		 762 aa  1003    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.4 
 
 		 761 aa  1046    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 		 756 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137711  normal  0.159136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.38 
 
 		 762 aa  1184    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.245739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.66 
 
 		 752 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.39 
 
 		 752 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70850  membrane protein component of ABC phosphate transporter  72.67 
 
 		 677 aa  1005    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.721295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6147  membrane protein component of ABC phosphate transporter  72.78 
 
 		 761 aa  1116    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.66 
 
 		 752 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.86 
 
 		 752 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 		 752 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.719566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.95 
 
 		 752 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.5 
 
 		 775 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.09 
 
 		 751 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 		 771 aa  632  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.68 
 
 		 751 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1408  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  48.04 
 
 		 751 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0601702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 		 751 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 		 752 aa  618  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.618473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 		 752 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000210465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 		 765 aa  607  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3642  phosphate ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 		 778 aa  591  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2454  phosphate import protein, transmembrane component PstC  42.69 
 
 		 735 aa  558  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01031  hypothetical protein  42.06 
 
 		 734 aa  545  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004380  phosphate transport system permease protein PstC  40.96 
 
 		 734 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0258  phosphate ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 		 731 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1228  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  42.11 
 
 		 743 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 		 719 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 		 722 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 		 724 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.875094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 		 742 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 		 722 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 		 718 aa  466  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.1 
 
 		 641 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0656  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.86 
 
 		 742 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.770286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 		 743 aa  422  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0916528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 		 706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 		 784 aa  395  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.462831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03151  putative phosphate ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 		 727 aa  268  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.35 
 
 		 336 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.35 
 
 		 336 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  40.79 
 
 		 336 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.35 
 
 		 325 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  35.98 
 
 		 318 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1234  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.49 
 
 		 387 aa  138  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4079  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  28.25 
 
 		 357 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.28 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.091837  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1039  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.04 
 
 		 387 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0327987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1619  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.16 
 
 		 388 aa  134  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0944  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.54 
 
 		 387 aa  134  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1244  phosphate ABC transporter permease  35.44 
 
 		 387 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.81986  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  30.98 
 
 		 350 aa  131  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  45.03 
 
 		 297 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.84 
 
 		 291 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.52 
 
 		 296 aa  129  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  44.91 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.18 
 
 		 645 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.96 
 
 		 297 aa  124  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  44.37 
 
 		 298 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.58 
 
 		 358 aa  120  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  43.62 
 
 		 296 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.07 
 
 		 309 aa  118  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.44 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.74 
 
 		 297 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 		 284 aa  114  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.5 
 
 		 303 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 		 292 aa  111  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.32 
 
 		 290 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.75 
 
 		 456 aa  110  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.62 
 
 		 291 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.96 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.67 
 
 		 283 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.62 
 
 		 291 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  26.43 
 
 		 343 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.62 
 
 		 291 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.45 
 
 		 308 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  45.14 
 
 		 649 aa  107  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.39 
 
 		 301 aa  107  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.67 
 
 		 604 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.73 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  28.24 
 
 		 497 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  42.95 
 
 		 320 aa  105  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2054  phosphate ABC transporter, permease protein  28.53 
 
 		 496 aa  104  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2139  phosphate ABC transporter, permease protein  28.53 
 
 		 496 aa  104  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.44 
 
 		 480 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.8 
 
 		 311 aa  104  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0221  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  32.23 
 
 		 302 aa  103  9e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000762818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>