130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2641 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
122 aa  240  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.29 
 
 
952 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  38.94 
 
 
713 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  36.13 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  44.32 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  35.51 
 
 
722 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.61 
 
 
579 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.32 
 
 
1045 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  36.28 
 
 
591 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35 
 
 
573 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 
203 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  35.71 
 
 
282 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.62 
 
 
817 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
214 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1921  hypothetical protein  44.44 
 
 
165 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.32 
 
 
743 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.94 
 
 
616 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  36.36 
 
 
195 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
122 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 
744 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.26 
 
 
281 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 
697 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  36.51 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
207 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  37.36 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  40.48 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  41.77 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  38.83 
 
 
716 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  36.89 
 
 
745 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  37.72 
 
 
470 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41 
 
 
211 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.46 
 
 
655 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36 
 
 
688 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  43.75 
 
 
765 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.96 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.75 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3435  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0121254  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 
855 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  36.89 
 
 
771 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  32.73 
 
 
805 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  39.39 
 
 
754 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  39.06 
 
 
753 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.78 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  31.3 
 
 
199 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
183 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  34.21 
 
 
123 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  37.65 
 
 
1225 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  39.39 
 
 
776 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 
1039 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 
251 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.96 
 
 
750 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  32.19 
 
 
800 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
160 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32 
 
 
549 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.26 
 
 
738 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  30.7 
 
 
1432 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
288 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 
355 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  35.14 
 
 
693 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
226 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.45 
 
 
743 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  36.59 
 
 
746 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
167 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.14 
 
 
728 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  33.05 
 
 
766 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  32.79 
 
 
365 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0034  hypothetical protein  35.59 
 
 
236 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1818  putative signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
244 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  32.41 
 
 
187 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4290  ATPase domain-containing protein  35.29 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.814219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>