108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1228 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
169 aa  327  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  64.57 
 
 
130 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 
167 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  37.75 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.16 
 
 
216 aa  85.1  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
183 aa  84.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.98 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  39.84 
 
 
1039 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.17 
 
 
573 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.13 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  39.44 
 
 
282 aa  62  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  40.18 
 
 
817 aa  61.6  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40 
 
 
1045 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
192 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.78 
 
 
738 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  35.85 
 
 
745 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  33.61 
 
 
123 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.02 
 
 
549 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 
146 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.21 
 
 
855 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
122 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
150 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 
713 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  33.94 
 
 
195 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.09 
 
 
952 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  34.82 
 
 
591 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 
135 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
356 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.33 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
133 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.82 
 
 
251 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
203 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 
211 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.85 
 
 
234 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 
697 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.62 
 
 
743 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
227 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.06 
 
 
579 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  35.29 
 
 
771 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
214 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
135 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  37.93 
 
 
716 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.5 
 
 
743 aa  48.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.98 
 
 
202 aa  47.8  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
119 aa  47.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.81 
 
 
616 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  51.02 
 
 
344 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
492 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40 
 
 
775 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  39 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  37.5 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  36.36 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3435  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0121254  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  30.52 
 
 
754 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
130 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
149 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 
180 aa  44.3  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 
744 aa  44.3  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  34.81 
 
 
365 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
517 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.04 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.2 
 
 
722 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
345 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
500 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  32.19 
 
 
776 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  43.33 
 
 
765 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  31.2 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  38 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
551 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 
746 aa  42  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4299  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.61 
 
 
256 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0265  hypothetical protein  29.61 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620382  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.72 
 
 
204 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  38.3 
 
 
1225 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  33.12 
 
 
693 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>