61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1873 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 149 aa  299  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  90.6 
 
 		 150 aa  276  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  88.59 
 
 		 150 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  92.86 
 
 		 150 aa  266  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5447  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 		 178 aa  97.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.97 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.48 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  37.74 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  30.89 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  31.39 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  35.96 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  35.45 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  29.67 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 484 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4220  histidine kinase  34.13 
 
 		 478 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 288 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  32.14 
 
 		 365 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  34.07 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  32.67 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4962  histidine kinase  34.71 
 
 		 481 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3198  histidine kinase  34.71 
 
 		 481 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 512 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 532 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  22.58 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  31.93 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  39.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 295 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  26.32 
 
 		 141 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  24.79 
 
 		 494 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 382 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  33.01 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 369 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3499  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 1093 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1522  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.74 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  24.71 
 
 		 353 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5041  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  28.78 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  30.69 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>