84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5266 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3056  putative regulatory protein  54.86 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.02 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.56 
 
 		 151 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.23 
 
 		 1045 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  34.39 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.64 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.52 
 
 		 738 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.35 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  34.88 
 
 		 713 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.69 
 
 		 693 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.82 
 
 		 817 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 		 132 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.3 
 
 		 743 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0374  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 146 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.16 
 
 		 722 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.41 
 
 		 694 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 158 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 135 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 150 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 		 119 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 		 122 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  27.22 
 
 		 744 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 160 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  29.69 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  33.14 
 
 		 800 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  31.01 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0969  hypothetical protein  32.41 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.82 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 135 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  30.82 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 		 288 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  32.39 
 
 		 148 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1306  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00486516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  37.25 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  31.21 
 
 		 855 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.45 
 
 		 1225 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  24.54 
 
 		 281 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 130 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  30.46 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  34.21 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  34.03 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  31.13 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  29.51 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.8 
 
 		 697 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0159  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  30.94 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  24.42 
 
 		 765 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 130 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  34.4 
 
 		 132 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 132 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 		 161 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  29.1 
 
 		 197 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  33.61 
 
 		 188 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.19 
 
 		 549 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.58 
 
 		 750 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>