48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3607 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0969  hypothetical protein  48.18 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  40.32 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  38.4 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1921  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.05 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  41.24 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 		 713 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  34.68 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  33.04 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.52 
 
 		 1045 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  35.79 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.09 
 
 		 952 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.13 
 
 		 616 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0374  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 		 1039 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4139  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  34.86 
 
 		 537 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  32.65 
 
 		 591 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11800  histidine kinase  29.73 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  31.15 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.98 
 
 		 728 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  36.67 
 
 		 817 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.07 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  34.09 
 
 		 693 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 203 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.42 
 
 		 738 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 716 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  36.46 
 
 		 1225 aa  40.8  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.08 
 
 		 549 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  27.56 
 
 		 722 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 214 aa  40.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.144417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>