97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8976 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
146 aa  295  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  57.66 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  43.08 
 
 
147 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
176 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 
159 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.5 
 
 
175 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3675  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.17 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.709341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0159  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.96 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 
265 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
1361 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  30 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
286 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  34.62 
 
 
828 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
1370 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1390 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1390 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1390 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  29.63 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  30 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
1385 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  31.62 
 
 
537 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  30.88 
 
 
148 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  24.14 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  32.5 
 
 
919 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  26.81 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3338  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
357 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  31.45 
 
 
851 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  26.81 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12220  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  31.2 
 
 
310 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  25.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  30.43 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0611  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  31.93 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3633  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  25.24 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1393  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.754718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4084  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  34.91 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  24.11 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5156  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  26.21 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5245  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4123  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5537  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  28.71 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  26.21 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1701  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  30 
 
 
140 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  21.23 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  23.7 
 
 
269 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  23.68 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0877  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  31.4 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
447 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  26.45 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  28.26 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1037  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  0.807046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1722  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  35.44 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0271292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1623  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  28.47 
 
 
162 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 
250 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>