97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4151 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 183 aa  356  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  39.16 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.19 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  36.92 
 
 		 817 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.55 
 
 		 952 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.09 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.66 
 
 		 1045 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  32.72 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  34.23 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  33.07 
 
 		 573 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  38.39 
 
 		 1039 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  33.09 
 
 		 591 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.61 
 
 		 579 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.1 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.43 
 
 		 738 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.9 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.49 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 		 122 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  34.43 
 
 		 745 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 		 697 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 		 251 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.15 
 
 		 549 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 227 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  35.2 
 
 		 771 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  34.96 
 
 		 716 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.67 
 
 		 728 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  31.45 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.4 
 
 		 616 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 295 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 		 722 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3207  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 281 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.65 
 
 		 743 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  34.65 
 
 		 855 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  33.93 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.29 
 
 		 155 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 		 356 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.69 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  40.17 
 
 		 1225 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1306  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00486516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  28.34 
 
 		 744 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  31.71 
 
 		 746 aa  45.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  31.97 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  32.73 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 132 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1818  putative signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0034  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0374  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  33.58 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4299  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.03 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  36.05 
 
 		 365 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 526 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2031  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 204 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  36.44 
 
 		 528 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 		 122 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  34.88 
 
 		 776 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  35.54 
 
 		 805 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0704  hypothetical protein  32.17 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  31.78 
 
 		 743 aa  40.8  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>