98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6464 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  331  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  44.8 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.62 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  35.14 
 
 
132 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  36.7 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3056  putative regulatory protein  34.48 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
255 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  32.58 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 
722 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 
122 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
164 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  39.36 
 
 
123 aa  51.2  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 
295 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  37.19 
 
 
713 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
130 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  33.73 
 
 
817 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  36.67 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
288 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  38.53 
 
 
1225 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.43 
 
 
738 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
171 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  32.82 
 
 
200 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.4 
 
 
1045 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.09 
 
 
952 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  37.07 
 
 
158 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  36.59 
 
 
134 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
143 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.7 
 
 
573 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 
697 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  30.28 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  31.25 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  31.78 
 
 
591 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 
211 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
132 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.18 
 
 
251 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  33.83 
 
 
766 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  30.08 
 
 
282 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
286 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.23 
 
 
616 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.57 
 
 
750 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  30.94 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
362 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.05 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  34.07 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.33 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.69 
 
 
234 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  30.77 
 
 
201 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3499  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
187 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
132 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  28.72 
 
 
281 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.21 
 
 
549 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
143 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.65 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
358 aa  40.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
130 aa  40.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0574046  hitchhiker  0.00140169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  31.5 
 
 
188 aa  40.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 
151 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
214 aa  40.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>