110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2307 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  53.29 
 
 
165 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 
205 aa  87.8  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.02 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
159 aa  84.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  39.29 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  38.33 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  36.92 
 
 
591 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  39.34 
 
 
817 aa  69.3  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.1 
 
 
952 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  38.14 
 
 
713 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  38.02 
 
 
697 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36 
 
 
573 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
855 aa  64.3  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.5 
 
 
549 aa  62.4  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 
146 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.22 
 
 
1045 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
145 aa  61.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
214 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  36.29 
 
 
722 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.64 
 
 
738 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  41.32 
 
 
365 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 
470 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 
776 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.7 
 
 
579 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
207 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.36 
 
 
616 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  38.53 
 
 
1039 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.64 
 
 
281 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.68 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  33.94 
 
 
158 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
135 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 
148 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
355 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.59 
 
 
234 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
227 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
150 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
119 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0374  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  32.58 
 
 
123 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2499  hypothetical protein  35.64 
 
 
105 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  35.48 
 
 
282 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3450  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
245 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.850015  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 
135 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  31.21 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 
152 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2666  putative signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
432 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 
149 aa  47.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
135 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4299  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.07 
 
 
256 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  29.68 
 
 
753 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
347 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211721  hitchhiker  0.0066599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  28.43 
 
 
202 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
1225 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.25 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
122 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.96 
 
 
775 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
132 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.93 
 
 
295 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  31.19 
 
 
134 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
251 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  32.81 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2031  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 
121 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1818  putative signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
134 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  36.17 
 
 
135 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  33.02 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  32.2 
 
 
694 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  44.23 
 
 
1432 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.39 
 
 
743 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3056  putative regulatory protein  30.23 
 
 
160 aa  42  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
356 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>