75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0233 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 347 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211721  hitchhiker  0.0066599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2666  putative signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  32.59 
 
 		 470 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  49.57 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.76 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4290  ATPase domain-containing protein  31.42 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.814219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  38.35 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2037  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.1 
 
 		 182 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.85 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  39.02 
 
 		 805 aa  59.3  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.94 
 
 		 549 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.8 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 		 132 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  43.48 
 
 		 713 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.88 
 
 		 573 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  35.2 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.27 
 
 		 137 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.9 
 
 		 146 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 		 129 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  36.16 
 
 		 195 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 		 180 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.64 
 
 		 688 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 207 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.1 
 
 		 141 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 		 122 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  45.45 
 
 		 738 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.03 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  36.15 
 
 		 722 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  43.42 
 
 		 713 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  40.71 
 
 		 123 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.52 
 
 		 199 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 132 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 693 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  38.33 
 
 		 161 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.5 
 
 		 745 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  37.41 
 
 		 176 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  31.71 
 
 		 771 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  36.59 
 
 		 817 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.22 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 135 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 143 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 		 716 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 		 147 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  40.21 
 
 		 181 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 		 1225 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 697 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 145 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 		 174 aa  46.2  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  35.37 
 
 		 158 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  32.21 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  33.67 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 1039 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  39.08 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 135 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  35.11 
 
 		 148 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.81 
 
 		 135 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 855 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 		 746 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 		 174 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 		 122 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  37.38 
 
 		 136 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 142 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.8 
 
 		 616 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.73 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 159 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 161 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 166 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  33.64 
 
 		 134 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.36 
 
 		 655 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.37 
 
 		 1045 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>