88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1650 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  91.33 
 
 		 150 aa  273  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  92.86 
 
 		 149 aa  266  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  87.33 
 
 		 150 aa  265  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5447  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 		 178 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.66 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  35.78 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  40.2 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 		 196 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  38.68 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  30.89 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 484 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  34.91 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  31.46 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 167 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  32.86 
 
 		 365 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 288 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  24.19 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  31.15 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 515 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 532 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  34.65 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  32.04 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4220  histidine kinase  33.86 
 
 		 478 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1522  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1093 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4962  histidine kinase  35.54 
 
 		 481 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3198  histidine kinase  35.54 
 
 		 481 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  33.88 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 551 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  26.47 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 492 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 924 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0922  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  25 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 		 295 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 382 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 819 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  28.78 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0755  putative regulatory protein  36.05 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.65 
 
 		 338 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 600 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  31.82 
 
 		 282 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000008  putative anti-sigma F factor antagonist  30.39 
 
 		 165 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.232541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 465 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 512 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 272 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 369 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  34.23 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 548 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.242459  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3612  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 422 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 1227 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 343 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4194  ATPase-like/sensor kinase  35.71 
 
 		 344 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  21.5 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 980 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 146 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>