34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2499 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2499  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  208  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  40.2 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.61 
 
 		 199 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  38 
 
 		 713 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  38.61 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  37.62 
 
 		 722 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 216 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  38.24 
 
 		 817 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  50 
 
 		 743 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  51.92 
 
 		 753 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  39.6 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 207 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  30.43 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.94 
 
 		 234 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 		 227 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4085  putative signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  53.06 
 
 		 765 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 744 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0034  hypothetical protein  37.76 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  51.02 
 
 		 754 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  39.73 
 
 		 776 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 697 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 1045 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 1432 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 356 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 		 122 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>