92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1818 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1818  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3207  anti-sigma-factor antagonist  37.55 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3450  anti-sigma-factor antagonist  33.48 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.850015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3753  hypothetical protein  35.16 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4299  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.27 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10959  hypothetical protein  33.76 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  38.24 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  46.3 
 
 		 738 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.16 
 
 		 952 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.59 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.7 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 		 122 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  37.59 
 
 		 745 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  36.89 
 
 		 771 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  32.81 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 		 122 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.2 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  39.16 
 
 		 716 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  41.51 
 
 		 693 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 		 174 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  41.03 
 
 		 573 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.89 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 167 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  41.76 
 
 		 135 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  32.43 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.96 
 
 		 142 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  27.63 
 
 		 155 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  36.89 
 
 		 158 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.07 
 
 		 750 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  38.68 
 
 		 1039 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  33.07 
 
 		 743 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  35 
 
 		 746 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 135 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 		 855 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 155 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 713 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 		 132 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  37.76 
 
 		 132 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.03 
 
 		 202 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.7 
 
 		 1045 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  36.89 
 
 		 365 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  33.65 
 
 		 591 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  34.48 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.78 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  31.37 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  38.55 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  41.86 
 
 		 123 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.85 
 
 		 693 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0969  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 		 130 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.13 
 
 		 722 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.07 
 
 		 613 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  35.11 
 
 		 164 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.58 
 
 		 817 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.05 
 
 		 616 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  36.72 
 
 		 1225 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.46 
 
 		 728 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  33.09 
 
 		 694 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 132 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 180 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  35.71 
 
 		 713 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  34.95 
 
 		 470 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 		 141 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.38 
 
 		 688 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 		 697 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  36.67 
 
 		 188 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  35.23 
 
 		 134 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 164 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>