36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4299 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4299  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 256 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3450  anti-sigma-factor antagonist  41.88 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.850015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3207  anti-sigma-factor antagonist  37.02 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10959  hypothetical protein  31.93 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1818  putative signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  38.18 
 
 		 722 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.77 
 
 		 952 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3753  hypothetical protein  28.86 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 		 159 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  33.65 
 
 		 1039 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.32 
 
 		 738 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.33 
 
 		 573 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.03 
 
 		 713 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 135 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  29.57 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 470 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  33.64 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  28.07 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 143 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 135 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  36.59 
 
 		 135 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  27.82 
 
 		 746 aa  45.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  33.61 
 
 		 771 aa  45.8  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.19 
 
 		 616 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 180 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 119 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1921  hypothetical protein  35.85 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  32.38 
 
 		 855 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  27.03 
 
 		 591 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 183 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.45 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 167 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>