40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10959 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10959  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3207  anti-sigma-factor antagonist  44.63 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3450  anti-sigma-factor antagonist  43.59 
 
 		 245 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.850015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4299  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.93 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1818  putative signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  33.61 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.28 
 
 		 122 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 		 738 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.31 
 
 		 616 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 150 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 135 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 180 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 135 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 722 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 180 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.14 
 
 		 573 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  34.31 
 
 		 1039 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 155 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.31 
 
 		 549 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.21 
 
 		 817 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.17 
 
 		 142 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 174 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 159 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.82 
 
 		 952 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  29.31 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3753  hypothetical protein  24.03 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  26.27 
 
 		 693 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  30.36 
 
 		 697 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  29.92 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  30.83 
 
 		 766 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 158 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  25.22 
 
 		 746 aa  42.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  34.94 
 
 		 745 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  28.48 
 
 		 800 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>