More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1582 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1582  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 		 741 aa  1465    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  28.97 
 
 		 219 aa  86.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  30.39 
 
 		 206 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  34.76 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  26.39 
 
 		 210 aa  76.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  26.51 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  26.91 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  28.96 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  29.84 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2567  inner membrane protein  30.65 
 
 		 203 aa  73.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.502771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  31.41 
 
 		 207 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  31.55 
 
 		 208 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  31.41 
 
 		 211 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0991  hypothetical protein  30.69 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.31278  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  25.89 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01709  hypothetical protein  27.31 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0180886  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0179  hypothetical protein  31.06 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0722  hypothetical protein  25.67 
 
 		 211 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2344  hypothetical protein  33.15 
 
 		 207 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.740415  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  28.22 
 
 		 215 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  29.28 
 
 		 208 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  31.61 
 
 		 207 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  25.76 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  26.63 
 
 		 200 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  24.73 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2155  protein of unknown function UPF0126  30.53 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004474  putative inner membrane protein  27.85 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  25.33 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3616  hypothetical protein  33.77 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2559  protein of unknown function UPF0126  30.53 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.374815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  29.76 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  25.35 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  31.55 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  29.73 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  28.78 
 
 		 213 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  28.78 
 
 		 213 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  28.78 
 
 		 213 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  26.37 
 
 		 209 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0350  hypothetical protein  31.42 
 
 		 246 aa  67.4  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  28.78 
 
 		 213 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  25.34 
 
 		 203 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  27.78 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  28.83 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  28.83 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  28.83 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  28.83 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  33.51 
 
 		 206 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  31.22 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  31.22 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  29.38 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1960  hypothetical protein  28.89 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2272  hypothetical protein  25.97 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  30 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20410  predicted membrane protein  29.05 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1558  yadS protein  30.24 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2180  hypothetical protein  27.08 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0870  hypothetical protein  28.8 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4375  protein of unknown function UPF0126  28.14 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133471  normal  0.220192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  26.98 
 
 		 219 aa  63.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  28.25 
 
 		 210 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4054  protein of unknown function UPF0126  27.27 
 
 		 211 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0621  hypothetical protein  28.25 
 
 		 210 aa  63.5  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.154187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  29.47 
 
 		 205 aa  63.9  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  35.48 
 
 		 206 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  31.15 
 
 		 206 aa  63.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  29.63 
 
 		 208 aa  62.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  29.23 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  30.39 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  27.23 
 
 		 207 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  29.83 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  26.09 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2999  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 		 206 aa  62.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.542645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  29.83 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  29.83 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3287  protein of unknown function UPF0126  30.11 
 
 		 221 aa  62  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3444  hypothetical protein  29.51 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  62  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00920  hypothetical protein  29.03 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  27.93 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  29.94 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  29.94 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  27.32 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  25.57 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  25.57 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3452  hypothetical protein  27.17 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  27.17 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5003  protein of unknown function UPF0126  26.67 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.001994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5955  hypothetical protein  29.61 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0408387  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0163  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  60.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0785  hypothetical protein  31.87 
 
 		 204 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2822  protein of unknown function UPF0126  40.54 
 
 		 218 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0167  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  26.63 
 
 		 202 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  26.63 
 
 		 202 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  26.63 
 
 		 202 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  31.35 
 
 		 207 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  26.63 
 
 		 202 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0721  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  26.63 
 
 		 202 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>