More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0138 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0138  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.737403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1695  peptidase M23B  52.74 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00365223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3254  peptidase M23B  51.08 
 
 		 234 aa  201  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2705  Peptidase M23  58.52 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000078524  unclonable  0.0000000000857144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1427  Peptidase M23  49.02 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1393  Peptidase M23  49.02 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1651  Peptidase M23  53.25 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  29.82 
 
 		 318 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  29.24 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  29.24 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  34.4 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  34.4 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  34.09 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  34.4 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  32.8 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  34.4 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  33.95 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  33.59 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  32.8 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  35.48 
 
 		 296 aa  72  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  32.8 
 
 		 282 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  32.82 
 
 		 328 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  32.8 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  36.29 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  35.48 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  32.81 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  39.09 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  38.18 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  35.48 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  32 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  34.4 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  30.34 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  34.03 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  32.72 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  36.13 
 
 		 386 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  34.51 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  33.6 
 
 		 280 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  35.29 
 
 		 665 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  33.06 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  33.06 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  30.08 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  32.12 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2837  Peptidase M23  30.08 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  33.57 
 
 		 649 aa  64.7  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  35.4 
 
 		 447 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  31.01 
 
 		 388 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  32.12 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.78 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  35.4 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.59 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.4 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.2 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  36.28 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  27.44 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.4 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  35.4 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.51 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  33.74 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  30.51 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  30.51 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  35.9 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  35.4 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  36.21 
 
 		 695 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  34.96 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  31.16 
 
 		 470 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  31.5 
 
 		 462 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.51 
 
 		 473 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  28.68 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  25.7 
 
 		 282 aa  62  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  30.36 
 
 		 442 aa  62  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  32.09 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  30.17 
 
 		 386 aa  62  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  31.01 
 
 		 336 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.28 
 
 		 470 aa  62  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  29.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  29.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  29.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  29.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  29.73 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  29.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  29.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  29.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  29.71 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  27.27 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  29.71 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  33.33 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  30.94 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  27.78 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  29.84 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  33.06 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  31.36 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  35.88 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  35.14 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  33.06 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>