192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0373 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0373  ribonuclease BN  100 
 
 		 277 aa  547  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0327  ribonuclease BN  42.75 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0692  ribonuclease BN  41.83 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.139852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1329  putative molybdopterin biosynthesis protein  46.12 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1593  ribonuclease BN  43.08 
 
 		 273 aa  214  8e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.949461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1217  tRNA-processing ribonuclease BN  42.52 
 
 		 270 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.130001  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1346  ribonuclease BN  39.37 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1225  YihY family protein  39.37 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.308333  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0518  YihY family protein  39.76 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0775636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  32.94 
 
 		 294 aa  148  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  32.94 
 
 		 294 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  32.94 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  28.25 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  28.25 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  28.25 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  28.25 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  28.25 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  26.55 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  28.2 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  27.37 
 
 		 412 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  28.31 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  26.16 
 
 		 340 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  24.06 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  24.71 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  24.71 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.3 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  24.63 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  27.27 
 
 		 405 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  29.63 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 337 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  24.9 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  24.62 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.57 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  28.16 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.69 
 
 		 411 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.69 
 
 		 411 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  27.8 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  27.69 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  24.62 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  28.63 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  21.96 
 
 		 451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  24.56 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  22.46 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  27.69 
 
 		 444 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  27.2 
 
 		 443 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  31.06 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  27.2 
 
 		 443 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  26.15 
 
 		 538 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  26.69 
 
 		 525 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  25.37 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  26.69 
 
 		 525 aa  109  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  24.34 
 
 		 408 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  28.22 
 
 		 439 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  24.49 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00593  ribonuclease BN  29.17 
 
 		 314 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  24.3 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  27.23 
 
 		 443 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  25.55 
 
 		 441 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  27.23 
 
 		 443 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  27.23 
 
 		 443 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  28.39 
 
 		 436 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  27.66 
 
 		 442 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  28.39 
 
 		 437 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  27.66 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  29.66 
 
 		 437 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  27.66 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1653  putative ribonuclease BN  24.55 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.957488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  24.18 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0716  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  26.42 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603481  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  26.81 
 
 		 442 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 437 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 437 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 437 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  27.54 
 
 		 437 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  27.54 
 
 		 437 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  26.39 
 
 		 499 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  20.8 
 
 		 432 aa  97.4  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 427 aa  96.3  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1200  putative ribonuclease BN  24.28 
 
 		 429 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1119  ribonuclease BN  24.28 
 
 		 429 aa  95.9  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04555  ribonuclease BN/unknown domain fusion protein  27.31 
 
 		 425 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  24.9 
 
 		 426 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>