173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1217 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1217  tRNA-processing ribonuclease BN  100 
 
 		 270 aa  529  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.130001  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1346  ribonuclease BN  71.64 
 
 		 268 aa  359  3e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1225  YihY family protein  71.64 
 
 		 268 aa  359  3e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.308333  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0518  YihY family protein  71.64 
 
 		 276 aa  358  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0775636  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0327  ribonuclease BN  53.28 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0692  ribonuclease BN  51.18 
 
 		 266 aa  251  6e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.139852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1329  putative molybdopterin biosynthesis protein  51.53 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1593  ribonuclease BN  46.64 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.949461  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0373  ribonuclease BN  42.52 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.09 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  30.08 
 
 		 538 aa  105  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1994  ribonuclease BN  27.16 
 
 		 443 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.20518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  26.8 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  27.45 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0034  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  23.72 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1664  ribonuclease BN  26.75 
 
 		 443 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0666088  hitchhiker  0.00703858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0030  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  26.32 
 
 		 441 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  26.87 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4186  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  27.05 
 
 		 445 aa  99  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03771  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4100  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4271  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4132  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4364  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03720  hypothetical protein  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.664641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4409  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5333  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.247154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4111  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  23.05 
 
 		 451 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  24.71 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.38 
 
 		 408 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  26.67 
 
 		 525 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  26.69 
 
 		 525 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  29.44 
 
 		 443 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  28.63 
 
 		 443 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  28.63 
 
 		 443 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  25.51 
 
 		 411 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  25.51 
 
 		 411 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.97 
 
 		 340 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  25.1 
 
 		 405 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0452  ribonuclease BN, putative  25.94 
 
 		 426 aa  92.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  28.63 
 
 		 442 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  28.63 
 
 		 442 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  28.63 
 
 		 442 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  28.23 
 
 		 442 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  27.02 
 
 		 437 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  26.51 
 
 		 439 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  26.03 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  23.86 
 
 		 447 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  24.9 
 
 		 320 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1013  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 427 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.58276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1354  ribonuclease BN  26.83 
 
 		 436 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875268  normal  0.303489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1471  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 422 aa  89.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.604096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  24.71 
 
 		 444 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  24.63 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  25.59 
 
 		 412 aa  89.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1323  ribonuclease BN  25.21 
 
 		 427 aa  89  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  26.61 
 
 		 437 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  26.61 
 
 		 437 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2773  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 437 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  26.61 
 
 		 437 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  26.61 
 
 		 437 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  26.61 
 
 		 437 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  23.74 
 
 		 337 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  23.74 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3404  ribonuclease BN  23.13 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  24.4 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1422  putative ribonuclease BN transmembrane protein  25.71 
 
 		 416 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00924301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  23.77 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  23.74 
 
 		 337 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  23.77 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  23.77 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  25.2 
 
 		 412 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  26.61 
 
 		 436 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  26.61 
 
 		 436 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  23.77 
 
 		 323 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  25 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  24.28 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0935  ribonuclease BN  25.21 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0901  tRNA-processing RNAse BN  24.8 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562692  decreased coverage  0.000000115397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0418  ribonuclease BN  24.9 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  23.35 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  23.67 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1670  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 403 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0638  putative ribonuclease BN  26.61 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00048226  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  27.39 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  27.39 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  27.06 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 446 aa  79  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>