More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4423 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4423  ABC transporter related  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.993853  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4898  ABC transporter related  87.98 
 
 		 210 aa  363  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2062  heme exporter protein CcmA  49.2 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  45.36 
 
 		 238 aa  144  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1506  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  46.49 
 
 		 232 aa  138  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23410  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.02 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.166652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3779  ABC transporter related  37.56 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  44.44 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  33.17 
 
 		 343 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  34.42 
 
 		 263 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0367  ABC transporter related  29.69 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.17 
 
 		 337 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  32.49 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0992  ABC transporter related  33.86 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  34.92 
 
 		 368 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4165  ABC transporter related  33 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  32.84 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  34.01 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3837  ABC transporter related  33 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  33.83 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  36.98 
 
 		 416 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1173  ABC transporter related  35.11 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470964  normal  0.243393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  32.81 
 
 		 372 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  33.33 
 
 		 359 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  32.46 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  32.09 
 
 		 263 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  34.36 
 
 		 383 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  36.84 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  33.83 
 
 		 328 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0313  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  36.5 
 
 		 430 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  34.05 
 
 		 311 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7227  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  34.33 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1154  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  33.33 
 
 		 328 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  33.17 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 		 240 aa  101  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.78 
 
 		 346 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  34.34 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  33.49 
 
 		 262 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  33.67 
 
 		 269 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  31.31 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  36.84 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  30.81 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  30.81 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.98 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.81 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0922  ABC transporter related  34.35 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0242  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  30.85 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762427  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.22 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  34.38 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.22 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  32.73 
 
 		 246 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  34 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.22 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  30.81 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  32.63 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1987  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  30.95 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7639  ABC transporter related protein  37.31 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  31.22 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  30.53 
 
 		 323 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0345  ABC transporter related  35.57 
 
 		 302 aa  99.8  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2701  ABC transporter related  34.39 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128649  normal  0.0320572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  34.04 
 
 		 318 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  33.16 
 
 		 323 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.29 
 
 		 351 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  33.17 
 
 		 342 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0671  ABC transporter related  29.74 
 
 		 310 aa  99.8  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  32.63 
 
 		 346 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  30.88 
 
 		 244 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  32.86 
 
 		 338 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  32.63 
 
 		 346 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 		 360 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  33.5 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>