More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2334 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  100 
 
 		 232 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  58.08 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  59.63 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  55.66 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23410  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.5 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.166652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3779  ABC transporter related  48.88 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4423  ABC transporter related  46.49 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.993853  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4898  ABC transporter related  45.95 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1506  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2062  heme exporter protein CcmA  47.67 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3666  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.459695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  35.83 
 
 		 315 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1173  ABC transporter related  38.03 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470964  normal  0.243393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0288  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.27 
 
 		 327 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467891  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  34.12 
 
 		 342 aa  111  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  34.52 
 
 		 352 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1668  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  26.99 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  39.08 
 
 		 315 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  27.88 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 354 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0916  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0694258 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  28.64 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.78 
 
 		 534 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  27.88 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  27.88 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  27.88 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  27.88 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  28.32 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  27.88 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  34.67 
 
 		 318 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  27.88 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  27.88 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  34.05 
 
 		 320 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  30.43 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  39.71 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  33.5 
 
 		 331 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  35.38 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  35.96 
 
 		 338 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  36.87 
 
 		 383 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 		 351 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  41.29 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  38.74 
 
 		 516 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.06 
 
 		 319 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.33 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1133  ABC transporter related  35.89 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  36.17 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  38.57 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0465  ABC transporter related  41.27 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.365708  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2847  Fis family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.801807  normal  0.896227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 301 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4171  ABC transporter related protein  39.36 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.53 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  35.53 
 
 		 304 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.53 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  33.17 
 
 		 333 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  35.05 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  30.58 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  32.7 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  31.53 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  27.8 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  36.45 
 
 		 416 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  35.5 
 
 		 338 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.96 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  34.8 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0922  ABC transporter related  34.76 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  36.22 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  34.47 
 
 		 360 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  32.99 
 
 		 319 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2542  putative maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  37.82 
 
 		 366 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  26.09 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1456  ABC-type sugar transport system, ATPase component  31.28 
 
 		 358 aa  105  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0435  ABC transporter related  38.73 
 
 		 332 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2684  ABC transporter related  35.05 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.924492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  32.55 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  37.84 
 
 		 314 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.73 
 
 		 346 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  35.32 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 		 365 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  34.26 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  37.77 
 
 		 374 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  34.18 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.99 
 
 		 349 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  35.15 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  32.68 
 
 		 308 aa  104  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.92 
 
 		 352 aa  104  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.33 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  30.33 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  30.33 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  26.83 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  26.83 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  38.61 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  35.64 
 
 		 344 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.84 
 
 		 370 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  32.68 
 
 		 330 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>