More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2062 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2062  heme exporter protein CcmA  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1506  ABC transporter related protein  69.61 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4423  ABC transporter related  49.2 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.993853  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4898  ABC transporter related  50.27 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  49.71 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  47.67 
 
 		 232 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 228 aa  130  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  47.15 
 
 		 240 aa  124  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3779  ABC transporter related  43.46 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  40.1 
 
 		 243 aa  121  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 303 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23410  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.77 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.166652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1150  ABC transporter related  38.83 
 
 		 372 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  41.8 
 
 		 324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  39.58 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  40.11 
 
 		 343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.63 
 
 		 377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  41.71 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1516  ABC transporter related  37.77 
 
 		 369 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00369229  normal  0.0599486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  42.25 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  37.06 
 
 		 361 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  37.77 
 
 		 381 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  41.15 
 
 		 756 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  36.57 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 		 240 aa  111  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  39.57 
 
 		 328 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  37.06 
 
 		 361 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  36.5 
 
 		 246 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  38.57 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2870  ABC alpha-glucoside transporter, ATPase subunit AglK  37.23 
 
 		 369 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0548699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  36.6 
 
 		 386 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  36.36 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 		 240 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  37.22 
 
 		 371 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  36.9 
 
 		 363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  40.64 
 
 		 387 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  37.22 
 
 		 371 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  36.32 
 
 		 362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  36.9 
 
 		 363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 		 372 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  39.3 
 
 		 338 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  36.26 
 
 		 354 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  37.62 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1207  ABC transporter related  38.73 
 
 		 342 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  36.67 
 
 		 372 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  36.67 
 
 		 372 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  36.67 
 
 		 372 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  37.23 
 
 		 381 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.6 
 
 		 386 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  38.43 
 
 		 258 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  41.85 
 
 		 408 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  34.97 
 
 		 350 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  39.04 
 
 		 362 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  35.71 
 
 		 362 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.6 
 
 		 386 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  41.4 
 
 		 271 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2659  ABC transporter related  34.67 
 
 		 374 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  37.43 
 
 		 378 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  34.22 
 
 		 345 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.08 
 
 		 386 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 		 386 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 		 386 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  39.04 
 
 		 331 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  35.83 
 
 		 370 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  37.8 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.63 
 
 		 348 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  36.92 
 
 		 333 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 		 240 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 		 240 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 		 240 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 		 240 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  42.47 
 
 		 471 aa  107  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 349 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 		 240 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  38.02 
 
 		 383 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  37.17 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  38.12 
 
 		 325 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  36.11 
 
 		 372 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 370 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  33.5 
 
 		 335 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  36.36 
 
 		 376 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  42.39 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  35.83 
 
 		 356 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3296  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.11 
 
 		 360 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.84 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  35.38 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  36.9 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>